RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589318.5

DDX39A-209, Transcript of DExD-box helicase 39A, human

TSL 1 (best)

Gene DDX39A, Length 1,903 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39A-209	ENST00000589318	PLCL1	Q15111	1095 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	INAVA	Q3KP66	663 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	XAF1	Q6GPH4	301 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PAQR7	Q86WK9	346 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TTL	Q8NG68	377 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FBXL20	Q96IG2	436 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SPACA7	Q96KW9	195 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF583	Q96ND8	569 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DUSP26	Q9BV47	211 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	REEP4	Q9H6H4	257 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	THADA	Q6YHU6	1953 aa		14.63	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MSANTD3-TMEFF1	A0A0A6YYJ0	341 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR6C74	A6NCV1	312 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LRIT2	A6NDA9	550 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EVPLL	A8MZ36	301 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C4orf51	C9J302	202 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RFXANK	O14593	260 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PPM1D	O15297	605 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NDUFS4	O43181	175 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SCO2	O43819	266 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C1QC	P02747	245 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ALB	P02768	609 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	UGT2B7	P16662	529 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AHR	P35869	848 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PLA2G16	P53816	162 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MLLT10	P55197	1068 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TAS2R50	P59544	299 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CPTP	Q5TA50	214 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C10orf111	Q8N326	155 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NELL1	Q92832	810 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FKBP10	Q96AY3	582 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	LHPP	Q9H008	270 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PIF1	Q9H611	641 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AHSP	Q9NZD4	102 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ITIH1	P19827	911 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	RCVRN	P35243	200 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MPEG1	Q2M385	716 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM209A	Q5JX71	171 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MMP21	Q8N119	569 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	MFSD4A	Q8N468	514 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CCDC115	Q96NT0	180 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX18	Q96RF0	628 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IER2	Q9BTL4	223 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KLHL31	Q9H511	634 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SNX7	Q9UNH6	387 aa		14.62	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	OR2A25	A4D2G3	310 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	TNFSF14	O43557	240 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	STATH	P02808	62 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IL3	P08700	152 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NCK1	P16333	377 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GZMM	P51124	257 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	PPP5C	P53041	499 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	NXPH1	P58417	271 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZXDA	P98168	799 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	C2orf80	Q0P641	193 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLC14A1	Q13336	389 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		14.61	□□□□□ -0.07
DDX39A-209	ENST00000589318	AMER3	Q8N944	861 aa		14.61	□□□□□ -0.07

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