RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 MAPK12P53778 367 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TAS2R50P59544 299 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 AP2B1P63010 937 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 LIPEQ05469 1076 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 RGS1Q08116 209 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 KCNAB2Q13303 367 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SQSTM1Q13501 440 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 FLOT2Q14254 428 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 MLC1Q15049 377 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TCEA2Q15560 299 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 HKDC1Q2TB90 917 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PGS1Q32NB8 556 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 LCN8Q6JVE9 175 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ARMC6Q6NXE6 501 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ATCAYQ86WG3 371 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PLD3Q8IV08 490 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 AQP12AQ8IXF9 295 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 FAM47BQ8NA70 645 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 IFI44Q8TCB0 444 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SSC4DQ8WTU2 575 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GAL3ST3Q96A11 431 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PPM1MQ96MI6 270 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ZNF583Q96ND8 569 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GBP5Q96PP8 586 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ALG2Q9H553 416 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 IL1RL2Q9HB29 575 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 S100A14Q9HCY8 104 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.3□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ARHGAP10A1A4S6 786 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GSAPA4D1B5 854 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CTSVO60911 334 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SH3BGRLO75368 114 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GPX2P18283 190 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CAPZBP47756 277 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GZMMP51124 257 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 MAZP56270 477 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SLC34A1Q06495 639 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SLC9A5Q14940 896 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 RABL3Q5HYI8 236 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TRIM40Q6P9F5 258 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 VASH2Q86V25 355 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ARL10Q8N8L6 244 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 OR6C4Q8NGE1 309 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 OR10G6Q8NH81 332 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 PPCDCQ96CD2 204 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ZNF285Q96NJ3 590 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SLC38A3Q99624 504 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 KLHL31Q9H511 634 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 STOML1Q9UBI4 398 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 ASB4Q9Y574 426 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.29□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 F8P00451 2351 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 C1orf226A1L170 272 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 RTCAO00442 366 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TXNDC9O14530 226 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 TMPRSS11DO60235 418 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 KRT36O76013 467 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 STAMBPO95630 424 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 IL3P08700 152 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 GLB1P16278 677 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 SSR2P43308 183 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 MAGEA8P43361 318 aa11.28□□□□□ -0.6
GGA3-217ENST00000583667 POLE2P56282 527 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms