RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf26Q96N11 449 aa31.02■■■□□ 2.56
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CTDNEP1-209ENST00000574205 SLCO1B7G3V0H7 640 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PGRMC2O15173 223 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PEX11AO75192 247 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 IL3P08700 152 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ICAM2P13598 275 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 HEPACAMQ14CZ8 416 aa31.01■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4N5Q8IXE1 308 aa31.01■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ADAP2Q9NPF8 381 aa31.01■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR75O95800 540 aa31■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CRLF3Q8IUI8 442 aa31■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 NUF2Q9BZD4 464 aa31■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KITP10721 976 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRD2P14416 443 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 HK2P52789 917 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TERF2Q15554 542 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf136Q5SQH8 315 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLAG1Q6DJT9 500 aa30.99■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa30.99■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MYNNQ9NPC7 610 aa30.99■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PARP9Q8IXQ6 854 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 MMP21Q8N119 569 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIMAP2Q9UG22 337 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CES1P1Q9UKY3 287 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PSME2Q9UL46 239 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 CEACAM4O75871 244 aa30.98■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIK3R1P27986 724 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AP2B1P63010 937 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS9BPQ6ZS82 235 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 KBTBD2Q8IY47 623 aa30.98■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TRPC5OSA6NMA1 111 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDC1P18827 310 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ITGA3P26006 1051 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 STT3AP46977 705 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLIN5Q00G26 463 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTBD16Q32M84 506 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC5Q8NAU1 212 aa30.97■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 DGAT2Q96PD7 388 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADNPQ9H2P0 1102 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBD1Q9UJT1 453 aa30.97■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 A8MUA0 341 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS4BO75351 444 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINA7P05543 415 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM87AP0C7U9 286 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 TACR1P25103 407 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC26A5P58743 744 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 WBP1Q96G27 269 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 EHD3Q9NZN3 535 aa30.96■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5AR2Q9P296 337 aa30.96■■■□□ 2.55
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CTDNEP1-209ENST00000574205 A6NL46 340 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX7A2P14406 83 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf80Q0P641 193 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 MYBPC3Q14896 1274 aa30.95■■■□□ 2.55
CTDNEP1-209ENST00000574205 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa30.95■■■□□ 2.55
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