RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAA20P61599 178 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CLCQ05315 142 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM156Q8N614 296 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 POGLUT1Q8NBL1 392 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR5L2Q8NGL0 311 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC2A12Q8TD20 617 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC126Q96EE4 140 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF382Q96SR6 550 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBK1Q9UHD2 729 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GUH1 482 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMPRSS11DO60235 418 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 DLX3O60479 287 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLRA3O75311 464 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GUCY1B2O75343 617 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT7LO94864 414 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPR75O95800 540 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 LDLRP01130 860 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSD3B1P14060 373 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSD3B2P26439 372 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALNSP34059 522 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSD17B3P37058 310 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRKAA2P54646 552 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDH13P55290 713 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 FOLH1Q04609 750 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBPJQ06330 500 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAPKAPK3Q16644 382 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 C18orf63Q68DL7 685 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52E8Q6IFG1 317 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 LETMD1Q6P1Q0 360 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GFRALQ6UXV0 394 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMD6Q96NE9 622 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 HES7Q9BYE0 225 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYOTQ9UBF9 498 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC14L3Q9UDX4 400 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 OSGIN2Q9Y236 505 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1W2PR48 441 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 GOLGA8RI6L899 631 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDH16O75309 829 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT6AP02538 564 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT6BP04259 564 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 MST1P26927 711 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT6CP48668 564 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 RNF4P78317 190 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMP22Q01453 160 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ID2Q02363 134 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC50Q53HI1 259 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF227Q86WZ6 799 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 METTL4Q8N3J2 472 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXL20Q96IG2 436 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM237Q96Q45 408 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 MYO9AB2RTY4 2548 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZGRF1Q86YA3 2104 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC151A5D8V7 595 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM200CA6NKL6 621 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 A8MVJ9 347 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BQF6 201 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2J2O76002 312 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 UNC5CO95185 931 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIFM1O95831 613 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDYNP01213 254 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SHBGP04278 402 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV3-11P04433 115 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT15P19012 456 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCT5P48643 541 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 HK2P52789 917 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 PKNOX1P55347 436 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCP2Q13094 533 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC153Q494R4 210 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4N5Q8IXE1 308 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUBPLQ8TB37 319 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 RDH11Q8TC12 318 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF721Q8TF20 911 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB15Q8WXK1 588 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms