RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559642.1

BMP4-208, Transcript of bone morphogenetic protein 4, human

TSL 3

Gene BMP4, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BMP4-208	ENST00000559642	PLIN3	O60664	434 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CDH16	O75309	829 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ITGA10	O75578	1167 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	AGFG2	O95081	481 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	EDN3	P14138	238 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CHN1	P15882	459 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KRT4	P19013	534 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MST1	P26927	711 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	STT3A	P46977	705 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TDGF1P3	P51864	188 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RASA2	Q15283	850 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	METTL4	Q8N3J2	472 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCNYL1	Q8N7R7	359 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NR4A3	Q92570	626 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SCMH1	Q96GD3	660 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	DGAT2	Q96PD7	388 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KCNA7	Q96RP8	456 aa		12	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM200C	A6NKL6	621 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	COPE	O14579	308 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PGRMC2	O15173	223 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SLC25A12	O75746	678 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	WISP2	O76076	250 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MLYCD	O95822	493 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NUDT17	P0C025	328 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	COX7A2	P14406	83 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CD46	P15529	392 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HMOX2	P30519	316 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CRHR1	P34998	444 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CYB561	P49447	251 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HLCS	P50747	726 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KCNK10	P57789	538 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PLIN5	Q00G26	463 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	LCP2	Q13094	533 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	WDR93	Q6P2C0	686 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MMP21	Q8N119	569 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CNPY4	Q8N129	248 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC63	Q8NA47	563 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	AGAP11	Q8TF27	550 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TANK	Q92844	425 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	WDR41	Q9HAD4	459 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	BRF2	Q9HAW0	419 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TIMM22	Q9Y584	194 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.99	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	WWP2	O00308	870 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NME2P1	O60361	137 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OR10H2	O60403	315 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	OR2J2	O76002	312 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ZFAND5	O76080	213 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	GPR75	O95800	540 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KRT6A	P02538	564 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KRT6B	P04259	564 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SP1	P08047	785 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NME2	P22392	152 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCT5	P48643	541 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	KRT6C	P48668	564 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SSR4	P51571	173 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HK2	P52789	917 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MAPK12	P53778	367 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	FOXA1	P55317	472 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ERVK-8	P63133	956 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	RNF4	P78317	190 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	EMB	Q6PCB8	327 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HSDL2	Q6YN16	418 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	PAGE2	Q7Z2X7	111 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	METTL6	Q8TCB7	284 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	FRMD6	Q96NE9	622 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		11.98	□□□□□ -0.49
BMP4-208	ENST00000559642	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.98	□□□□□ -0.49

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