RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 SCTRP47872 440 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 PTH2RP49190 550 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 RGS4P49798 205 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 HSD17B7P56937 341 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 RAB38P57729 211 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 RNF4P78317 190 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 REEP5Q00765 189 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 STX4Q12846 297 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 CTBP1Q13363 440 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 RUNX2Q13950 521 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 CTAGE6Q86UF2 777 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 TRPV3Q8NET8 790 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 OR5L2Q8NGL0 311 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 OR14A16Q8NHC5 309 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 SLC5A11Q8WWX8 675 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 KCNJ9Q92806 393 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 NEIL2Q969S2 332 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ISL2Q96A47 359 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 SNF8Q96H20 258 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF597Q96LX8 424 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 GAL3ST4Q96RP7 486 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 CSF3RQ99062 836 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 NDNQ99608 321 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 DOHHQ9BU89 302 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 KIFC1Q9BW19 673 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 PARVBQ9HBI1 364 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 KLHL28Q9NXS3 571 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 RNF14Q9UBS8 474 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 SOX13Q9UN79 622 aa7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PCNX1-215ENST00000557428 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SONP18583 2426 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 AP3B1O00203 1094 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 LDB3O75112 727 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ACSL3O95573 720 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CERS1P27544 350 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 AHRP35869 848 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SLC1A2P43004 574 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MSH2P43246 934 aa7.39□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 PLA2G16P53816 162 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SP140Q13342 867 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 VEZF1Q14119 521 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 RCAN2Q14206 197 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 C4orf22Q6V702 233 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CREG2Q8IUH2 290 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MORN4Q8NDC4 146 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 DOK4Q8TEW6 326 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 LINGO1Q96FE5 620 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.39□□□□□ -1.23
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PCNX1-215ENST00000557428 TIMP4Q99727 224 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MED18Q9BUE0 208 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 YAE1D1Q9NRH1 226 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 MED16Q9Y2X0 877 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 TESMINQ9Y4I5 508 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.39□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 A0A088AWK7 358 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 RNF223E7ERA6 249 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 H0Y3Z8 333 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 SERPINA6P08185 405 aa7.38□□□□□ -1.23
PCNX1-215ENST00000557428 CYP4B1P13584 511 aa7.38□□□□□ -1.23
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