RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD46Q86W74 232 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DEFB107AQ8IZN7 70 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ESX1Q8N693 406 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FITM2Q8N6M3 262 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OR7A2PQ8NGA2 310 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 VPS33AQ96AX1 596 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RNF31Q96EP0 1072 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NPAS2Q99743 824 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CRB3Q9BUF7 120 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RXFP3Q9NSD7 469 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 EHD3Q9NZN3 535 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MMACHCQ9Y4U1 282 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DOCK9Q9BZ29 2069 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 A8MUA0 341 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 P2RX6O15547 441 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 COQ9O75208 318 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ETHE1O95571 254 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GPR75O95800 540 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 IGHEP01854 428 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CRATP43155 626 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PGDP52209 483 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NSDHLQ15738 373 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 REP15Q6BDI9 236 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FAAH2Q6GMR7 532 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OR9I1Q8NGQ6 314 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ROPN1LQ96C74 230 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PRR14Q9BWN1 585 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ACTL8Q9H568 366 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO8Q9NRD0 319 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 THSD1Q9NS62 852 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CFL2Q9Y281 166 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CUL9Q8IWT3 2517 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP73A6NFT4 308 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF195O14628 629 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 BRINP1O60477 761 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 AIFM1O95831 613 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 IFNA14P01570 189 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GSNP06396 782 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FHP07954 510 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CCL4P13236 92 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GPX3P22352 226 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LIM2P55344 173 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 FOXC1Q12948 553 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GNA13Q14344 377 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TESCQ96BS2 214 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MOAP1Q96BY2 351 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 EXD2Q9NVH0 621 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DAPP1Q9UN19 280 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 KNTC1P50748 2209 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MEN1O00255 615 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 CTNSO60931 367 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 C6orf47O95873 294 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 B3GALT4O96024 378 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 LAMP1P11279 417 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 ATP6V1C1P21283 382 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 TACR1P25103 407 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 GABREP78334 506 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRO-210ENST00000544244 MC1RQ01726 317 aa5.35□□□□□ -1.55
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