RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	OR1D2	P34982	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CHRNA7	P36544	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	MATK	P42679	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SELENOV	P59797	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TUBA4A	P68366	448 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ZXDB	P98169	803 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	GHRHR	Q02643	423 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ACY1	Q03154	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	OPCML	Q14982	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	MAPK6	Q16659	721 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PTOV1	Q86YD1	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LRR1	Q96L50	414 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	C12orf66	Q96MD2	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ANKRD27	Q96NW4	1050 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	ACCS	Q96QU6	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NPAS2	Q99743	824 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	CDH9	Q9ULB4	789 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRR4-209	ENST00000541456	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	MEI4	A8MW99	385 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	TIMM23	O14925	209 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	SOX30	O94993	753 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC172	P0C7W6	258 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ODC1	P11926	461 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CD59	P13987	128 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	UQCRB	P14927	111 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	B4GALT1	P15291	398 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	PRKACA	P17612	351 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	HNF1A	P20823	631 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CD1B	P29016	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ACADSB	P45954	432 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	FNTA	P49354	379 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CNTN2	Q02246	1040 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ID2	Q02363	134 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	MFAP5	Q13361	173 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF284	Q2VY69	593 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRR4-209	ENST00000541456	ANO5	Q75V66	913 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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