RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533342.5

ANKRD42-209, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 1,949 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-209ENST00000533342 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 C1QL3Q5VWW1 255 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 MDGA2Q7Z553 956 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CCDC63Q8NA47 563 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 C5orf34Q96MH7 638 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 DGAT2Q96PD7 388 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 RNF32Q9H0A6 362 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ADGRE2Q9UHX3 823 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TMCO1Q9UM00 188 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 MYO7BQ6PIF6 2116 aa10.07□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRK2Q5S007 2527 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 G3V2L1 256 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 MANBAO00462 879 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 UGDHO60701 494 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A12O75746 678 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 OR6B1O95007 311 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 OTCP00480 354 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SP1P08047 785 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 NR2F6P10588 404 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 COL8A1P27658 744 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SERPINB3P29508 390 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TDGF1P3P51864 188 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 RCN2Q14257 317 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 RNFT1Q5M7Z0 435 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SLC25A25Q6KCM7 469 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 IL20RBQ6UXL0 311 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 GFRALQ6UXV0 394 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 FJX1Q86VR8 437 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 NUDT13Q86X67 352 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM156Q8N614 296 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 NR4A3Q92570 626 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SERPINI1Q99574 410 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 OCEL1Q9H607 264 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 VTI1BQ9UEU0 232 aa10.06□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A0G2JMM0 328 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PPB8 328 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 A0A1W2PRS3 328 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 KIR3DP1A8MWS1 328 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 NPIPA5E9PKD4 350 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 LRRTM2O43300 516 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZFAND5O76080 213 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 LRATO95237 230 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 PROCP04070 461 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 MYL2P10916 166 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CD46P15529 392 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 IMPDH1P20839 514 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TNFRSF8P28908 595 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SOX3P41225 446 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CYB561P49447 251 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 PRKAA2P54646 552 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 FOXA1P55317 472 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ERVK-8P63133 956 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 HMGCS1Q01581 520 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CUL3Q13618 768 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SH2D5Q6ZV89 423 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 COMMD6Q7Z4G1 85 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZNF721Q8TF20 911 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SLX1AQ9BQ83 275 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 GSTO2Q9H4Y5 243 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 PHF11Q9UIL8 331 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 NPIPA1Q9UND3 350 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ERVK-19Q9WJR5 959 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 FIS1Q9Y3D6 152 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 FCHO1O14526 889 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 OR10H2O60403 315 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SPAG7O75391 227 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 SLU7O95391 586 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 EDN3P14138 238 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 KRT4P19013 534 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 HMOX2P30519 316 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 HK2P52789 917 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ASPHQ12797 758 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 ZYG11AQ6WRX3 759 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 TMEM64Q6YI46 380 aa10.05□□□□□ -0.8
ANKRD42-209ENST00000533342 HSDL2Q6YN16 418 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms