RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 ASPDHA6ND91 283 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PRMT3O60678 531 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ONECUT2O95948 504 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PGRP06401 933 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 S100A3P33764 101 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 WNT3P56703 355 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NCF4Q15080 339 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC116Q8IYX3 515 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CLECL1Q8IZS7 167 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TESCQ96BS2 214 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SPDL1Q96EA4 605 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PTCHD1Q96NR3 888 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SPSB2Q99619 263 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP26Q9BV47 211 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SDK2Q58EX2 2172 aa21.36■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 C9J4A7 227 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CBX6O95503 412 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RECKO95980 971 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 KIR3DL1P43629 444 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTM5P46439 218 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CPA2P48052 419 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 XKP51811 444 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK10P57789 538 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 C21orf58P58505 322 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RCAN2Q14206 197 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 COQ8BQ96D53 544 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1F2PQ96R84 312 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OR52E6Q96RD3 313 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ERVK-11Q9UQG0 969 aa21.35■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN2AQ99250 2005 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 VSTM2BA6NLU5 285 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RHAGQ02094 409 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC2A7Q6PXP3 512 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF595Q8IYB9 648 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ESX1Q8N693 406 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4K14Q8NGD5 310 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 THSD1Q9NS62 852 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FRYQ5TBA9 3013 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC154A6NI56 674 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 IDSB3KWA1 339 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CLDN4O14493 209 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CTNSO60931 367 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR75O95800 540 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 LTB4RQ15722 352 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 LANCL3Q6ZV70 420 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ADCY4Q8NFM4 1077 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TANKQ92844 425 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NKD1Q969G9 470 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF681Q96N22 645 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 INPP5KQ9BT40 448 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 TGIF2Q9GZN2 237 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 EHD3Q9NZN3 535 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 C3orf18Q9UK00 162 aa21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 FBP2O00757 339 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 DXOO77932 396 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 STX4Q12846 297 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 PAGE3Q5JUK9 113 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 RETREG3Q86VR2 466 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 NPAS2Q99743 824 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 SLAMF8Q9P0V8 285 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa21.33■■□□□ 1.01
TSNARE1-208ENST00000524325 CCT8L1PA6NM43 557 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 A8MUA0 341 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 PDPK1O15530 556 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 SCN2BO60939 215 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 HEXBP07686 556 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 COX4I1P13073 169 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 DLSTP36957 453 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 STAT5AP42229 794 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 NSDHLQ15738 373 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC4FQ8N1N0 589 aa21.32■■□□□ 1
TSNARE1-208ENST00000524325 IL22RA1Q8N6P7 574 aa21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms