RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 MAXP61244 160 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 VLDLRP98155 873 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZVU0 165 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 VTCN1Q7Z7D3 282 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LPCAT1Q8NF37 534 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WBP1Q96G27 269 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RBP7Q96R05 134 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RERGLQ9H628 205 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ASB1Q9Y576 335 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 LRRC72A6NJI9 287 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 VPS26AO75436 327 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 B3GALT4O96024 378 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CCNCP24863 283 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF4P43489 277 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C2orf80Q0P641 193 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR8K5Q8NH50 307 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FANK1Q8TC84 345 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PTP4A1Q93096 173 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TEX46H3BTG2 121 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KDELR3O43731 214 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TPOP07202 933 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ACSM4P0C7M7 580 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GRIK2Q13002 908 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FCN2Q15485 313 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC14A2Q15849 920 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 APCDD1Q8J025 514 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WDR48Q8TAF3 677 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CXorf40AQ8TE69 158 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF599Q96NL3 588 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 COL21A1Q96P44 957 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PITX2Q99697 317 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GALPQ9UBC7 116 aa9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 STX16O14662 325 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HRGP04196 525 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FAM157BP0CG42 384 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HTR6P50406 440 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CLLU1Q5K131 121 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HDDC3Q8N4P3 179 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AADATQ8N5Z0 425 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF416Q9BWM5 594 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MYO10Q9HD67 2058 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 DRGXA6NNA5 263 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SUPT3HB4E1H0 165 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 VPS4BO75351 444 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 PDE9AO76083 593 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SCELO95171 688 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 HLA-FP30511 346 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 STK19P49842 368 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CLCN5P51795 746 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C22orf39Q6P5X5 142 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 FAM181AQ8N9Y4 354 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 OR2AP1Q8NGE2 309 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 GPR150Q8NGU9 434 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RSPRY1Q96DX4 576 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 WDFY2Q96P53 400 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ATOH8Q96SQ7 321 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SLC35F4A4IF30 521 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ANHXE9PGG2 379 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 M0R296 226 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 MATN3O15232 486 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SEC14L5O43304 696 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV3-27P01718 113 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RETP07949 1114 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 SDHBP21912 280 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RORCP51449 518 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 AP1S1P61966 158 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ABATP80404 500 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 ZXDAP98168 799 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZNB5 142 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 C17orf107Q6ZR85 190 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 USP45Q70EL2 814 aa9.63□□□□□ -0.87
TRPS1-211ENST00000520276 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms