RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 POLEQ07864 2286 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PCM1Q15154 2024 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 H3BMH7 237 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FCHO1O14526 889 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 GNLYP22749 145 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PSMA3P25788 255 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SHMT2P34897 504 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FOXO1Q12778 655 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 KRT33BQ14525 404 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PRPSAP1Q14558 356 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 NADK2Q4G0N4 442 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AWAT1Q58HT5 328 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SPESP1Q6UW49 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 PACS1Q6VY07 963 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AMIGO1Q86WK6 493 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 ZNF575Q86XF7 245 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 IQCKQ8N0W5 287 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FAR2Q96K12 515 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 C5orf34Q96MH7 638 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 CHP1Q99653 195 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 NUDT9Q9BW91 350 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 COG4Q9H9E3 785 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 OR6C2Q9NZP2 312 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 LRFN1Q9P244 771 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 POLG2Q9UHN1 485 aa6.47□□□□□ -1.37
PDE4D-222ENST00000514552 GSAPA4D1B5 854 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TCP11X1B4DZS4 312 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 BTN3A3O00478 584 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LDB2O43679 373 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AGTP01019 485 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FTH1P02794 183 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ST6GAL1P15907 406 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CA5AP35218 305 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NSG1P42857 185 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CCL11P51671 97 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CHAF1BQ13112 559 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ITIH4Q14624 930 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 DET1Q7L5Y6 550 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 CFAP206Q8IYR0 622 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ZBTB2Q8N680 514 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR4E2Q8NGC2 313 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ACTL9Q8TC94 416 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NPIPB3Q92617 1050 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA13Q96N96 652 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NUAK2Q9H093 628 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 ESPL1Q14674 2120 aa6.46□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 PDZD2O15018 2839 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 A0A0J9YY10 115 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 BTNL10A8MVZ5 291 aa6.45□□□□□ -1.38
PDE4D-222ENST00000514552 H7C0C1 242 aa6.45□□□□□ -1.38
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