RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 PPP2R1BP30154 601 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 GP5P40197 560 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 FNTAP49354 379 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 SLC3A1Q07837 685 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 GSG1Q2KHT4 349 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 C2orf83Q53S99 150 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-221ENST00000514231 SERINC2Q96SA4 455 aa3.59□□□□□ -1.83
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PDE4D-221ENST00000514231 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 AGAP6Q5VW22 663 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 SYT7O43581 403 aa3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 HSD17B1P14061 328 aa3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 OR1K1Q8NGR3 316 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 C16orf58Q96GQ5 468 aa3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.57□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.55□□□□□ -1.84
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PDE4D-221ENST00000514231 PCED1BQ96HM7 432 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 WWP1Q9H0M0 922 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 ST8SIA3O43173 380 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-221ENST00000514231 GPX3P22352 226 aa3.54□□□□□ -1.84
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