RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	ELOA3	Q8NG57	546 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DPH7	Q9BTV6	452 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SARDH	Q9UL12	918 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GTW7	788 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		H7C0S8	307 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TGM5	O43548	720 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	KLKB1	P03952	638 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	C6	P13671	934 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TYRP1	P17643	537 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DCK	P27707	260 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	VIPR2	P41587	438 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEA12	P43365	314 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ODF4	Q2M2E3	257 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DEFB134	Q4QY38	66 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SHF	Q7M4L6	423 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR8K5	Q8NH50	307 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HMGB4	Q8WW32	186 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NEIL2	Q969S2	332 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NTMT1	Q9BV86	223 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NEK6	Q9HC98	313 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TLR9	Q9NR96	1032 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ABCG2	Q9UNQ0	655 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	BTAF1	O14981	1849 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF195	O14628	629 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	AGR2	O95994	175 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ALPL	P05186	524 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF24	P17028	368 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PFKL	P17858	780 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ATF6	P18850	670 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HK1	P19367	917 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFS1	P28331	727 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PTGER1	P34995	402 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TGFBR2	P37173	567 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CLCN7	P51798	805 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CTSC	P53634	463 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ADAM15	Q13444	863 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	PON3	Q15166	354 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OSTF1	Q92882	214 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ITFG2	Q969R8	447 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR51E2	Q9H255	320 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CDH7	Q9ULB5	785 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PP55	124 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ISPD	A4D126	451 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	IGLON5	A6NGN9	336 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GABRR3	A8MPY1	467 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	CD2	P06729	351 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	NUDT7	P0C024	238 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GIMD1	P0DJR0	217 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	AKT2	P31751	481 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	IGFALS	P35858	605 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	GCGR	P47871	477 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	DNASE1L1	P49184	302 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	AKR1D1	P51857	326 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SELENOW	P63302	87 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MAB21L1	Q13394	359 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	IRF5	Q13568	498 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SUN5	Q8TC36	379 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	TM9SF2	Q99805	663 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193	HCN2	Q9UL51	889 aa		7.7	□□□□□ -1.18
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PRQ8	180 aa		7.69	□□□□□ -1.18

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