RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GLIPR2Q9H4G4 154 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SERHL2Q9H4I8 314 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NEUROD4Q9HD90 331 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 THSD1Q9NS62 852 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C2orf42Q9NWW7 574 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFAF4Q9P032 175 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C5AR2Q9P296 337 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKMY1Q9P2S6 941 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CYP8B1Q9UNU6 501 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ATG4BQ9Y4P1 393 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR5K4A6NMS3 321 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 WASHC1A8K0Z3 465 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PGRMC2O15173 223 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PROM1O43490 865 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 LAMTOR5O43504 91 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 HS6ST1O60243 411 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 MITFO75030 526 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GUCY1B2O75343 617 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 DIRAS1O95057 198 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RECKO95980 971 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 IFNA14P01570 189 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C9P02748 559 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 STATHP02808 62 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 UGT2B7P16662 529 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 AQP1P29972 269 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CD6P30203 668 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PIGAP37287 484 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CCT3P49368 545 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RAD23AP54725 363 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ISL1P61371 349 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR18Q14330 331 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PLCL1Q15111 1095 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CEBPEQ15744 281 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 IFI44LQ53G44 452 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 LAIR2Q6ISS4 152 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 REEP3Q6NUK4 255 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM64Q6YI46 380 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ASPGQ86U10 573 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ARMC8Q8IUR7 673 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR4C15Q8NGM1 316 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8K5Q8NH50 307 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GAL3ST3Q96A11 431 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 TPD52L3Q96J77 140 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 OR2A5Q96R48 311 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF347Q96SE7 839 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 EPYCQ99645 322 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR174Q9BXC1 333 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 GSDMCQ9BYG8 508 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 LMAN1LQ9HAT1 526 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ZSCAN32Q9NX65 697 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTR10Q9NZ32 417 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 NCDNQ9UBB6 729 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 C3orf18Q9UK00 162 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 BAG5Q9UL15 447 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 ANGPT4Q9Y264 503 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 CEPT1Q9Y6K0 416 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 U3KQV3 271 aa10.21□□□□□ -0.77
SH3BP2-209ENST00000504450 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A0G2JNG1 304 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A1W2PPC4 97 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 OR6C74A6NCV1 312 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM170BA6NMN3 283 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 KIR2DS3K7RE56 304 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 ZW10O43264 779 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PRAMEF10O60809 474 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CTSVO60911 334 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LRP4O75096 1905 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 NDUFS2O75306 463 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 JRKO75564 520 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 AIFM1O95831 613 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CD247P20963 164 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 RYKP34925 604 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 LSSP48449 732 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 HLCSP50747 726 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 RPS6KA3P51812 740 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 HMGA2P52926 109 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP2Q05923 314 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 TGM3Q08188 693 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP2-209ENST00000504450 CD47Q08722 323 aa10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms