RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488741.5

CREM-238, Transcript of cAMP responsive element modulator, human

TSL 2 BASIC

Gene CREM, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CREM-238	ENST00000488741	F2	P00734	622 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PRL	P01236	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IGLV3-27	P01718	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RAF1	P04049	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IFNA16	P05015	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	COL6A1	P12109	1028 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OSM	P13725	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ARSB	P15848	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DPEP1	P16444	411 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RHCE	P18577	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	HK1	P19367	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ITGAL	P20701	1170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C4BPB	P20851	252 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CNR2	P34972	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ACVRL1	P37023	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LIMS1	P48059	325 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	HNMT	P50135	292 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CPT1A	P50416	773 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CRISP3	P54108	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CDH12	P55289	794 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PER3	P56645	1201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ABAT	P80404	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ILK	Q13418	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	KCNC3	Q14003	757 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	RGN	Q15493	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TCEA2	Q15560	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DUSP6	Q16828	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	UPP1	Q16831	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	UGT8	Q16880	541 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PLK5	Q496M5	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	GCNT6	Q5T4J0	391 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C12orf73	Q69YU5	71 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LAMTOR1	Q6IAA8	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LUZP2	Q86TE4	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ASPG	Q86U10	573 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ANKRD46	Q86W74	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LAS2	Q8IYD9	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SPATA17	Q96L03	361 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NELL2	Q99435	816 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	KCNJ15	Q99712	375 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	DUSP26	Q9BV47	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CREM-238	ENST00000488741	TMEM38A	Q9H6F2	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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