RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488403.5

NOP58-208, Transcript of NOP58 ribonucleoprotein, human

TSL 2

Gene NOP58, Length 871 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOP58-208	ENST00000488403	TMPRSS11D	O60235	418 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NPHS1	O60500	1241 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GUCY1B2	O75343	617 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZWINT	O95229	277 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GBA	P04062	536 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	IFNA16	P05015	189 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	KLK1	P06870	262 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	BPGM	P07738	259 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	UROS	P10746	265 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NEFH	P12036	1026 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PPP2R1B	P30154	601 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HTR6	P50406	440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TNFRSF17	Q02223	184 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERTAD2	Q14140	314 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TANK	Q92844	425 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ATG4B	Q9Y4P1	393 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CENPE	Q02224	2701 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	WIPF3	A6NGB9	483 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403		A8MUA0	341 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PROM1	O43490	865 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CHEK2	O96017	543 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	LDLR	P01130	860 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	NR2F6	P10588	404 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERPINB5	P36952	375 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ETV4	P43268	484 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERPINB4	P48594	390 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MAPK12	P53778	367 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FOXA1	P55317	472 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SLC26A5	P58743	744 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TAS2R50	P59544	299 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GRHL3	Q8TE85	626 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MMP25	Q9NPA2	562 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ASB4	Q9Y574	426 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	POLE	Q07864	2286 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SVIL	O95425	2214 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403		A0A1W2PR48	441 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403		A8MUI8	341 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	AZIN1	O14977	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	BIRC5	O15392	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	LDB3	O75112	727 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MYO1D	O94832	1006 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CLDN1	O95832	211 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CELA2A	P08217	269 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ITGAM	P11215	1152 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	CHN1	P15882	459 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TNNI3	P19429	210 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SERPINB3	P29508	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HMGCS1	Q01581	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ID2	Q02363	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	BIK	Q13323	160 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	MFAP5	Q13361	173 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SPIN4	Q56A73	249 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	C18orf63	Q68DL7	685 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	HDX	Q7Z353	690 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NOP58-208	ENST00000488403	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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