RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CACNA1AO00555 2505 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TECTAO75443 2155 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 OR52A4PA6NMU1 304 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MYO1GB0I1T2 1018 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CLIC1O00299 241 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 AXIN1O15169 862 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 KDM1AO60341 852 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RASGRP1O95267 797 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DCNP07585 359 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 THEGLP0DJG4 465 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 AMD1P17707 334 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 NDUFS1P28331 727 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 SERPINB1P30740 379 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 KDELR2P33947 212 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PCGF2P35227 344 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 SLC19A1P41440 591 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RAB28P51157 221 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PPP5CP53041 499 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CDC20Q12834 499 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 INAQ16352 499 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 GTDC1Q4AE62 458 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 NOXRED1Q6NXP6 359 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 USP43Q70EL4 1123 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 AMER2Q8N7J2 671 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 OR2A1Q8NGT9 310 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CLHC1Q8NHS4 586 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 SLC38A4Q969I6 547 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DACH2Q96NX9 599 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TSSK3Q96PN8 268 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RHBGQ9H310 441 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PELI2Q9HAT8 420 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ERVK-18Q9QC07 812 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MOSPD1Q9UJG1 213 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ICKQ9UPZ9 632 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PADI2Q9Y2J8 665 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 U3KQV3 271 aa9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 OR2A25A4D2G3 310 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PDZK1P1A8MUH7 402 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 EFCAB9A8MZ26 197 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 XPNPEP2O43895 674 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 FADS2O95864 444 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MT-ND2P03891 347 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 GSNP06396 782 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 F3P13726 295 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 COX7A2P14406 83 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ITGA2P17301 1181 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 ENGP17813 658 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 FMO3P31513 532 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 KRT20P35900 424 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PIK3CBP42338 1070 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CLK3P49761 638 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DAPP51397 102 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MLLT10P55197 1068 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 DMWDQ09019 674 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 RBBP4Q09028 425 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 SPIN4Q56A73 249 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 MED27Q6P2C8 311 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC81Q6ZN84 652 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT5Q7Z7M9 940 aa9.13□□□□□ -0.95
POLR1A-208ENST00000486964 CYP4Z1Q86W10 505 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms