RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478423.6

NPHP4-208, Transcript of nephrocystin 4, human

TSL 2

Gene NPHP4, Length 4,467 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPHP4-208	ENST00000478423	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	APOO	Q9BUR5	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	COMMD9	Q9P000	198 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SCML1	Q9UN30	329 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ANHX	E9PGG2	379 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423		H7C0S8	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PRL	P01236	227 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	DRD1	P21728	446 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CDK3	Q00526	305 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OTUD1	Q5VV17	481 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	NAGS	Q8N159	534 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MKLN1	Q9UL63	735 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CCNK	O75909	580 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC9A3	P48764	834 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PDZD3	Q86UT5	571 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MEIOB	Q8N635	442 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PIGK	Q92643	395 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	C7	P10643	843 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CLCN2	P51788	898 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PIGF	Q07326	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	NPRL3	Q12980	569 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OSTF1	Q92882	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TRIM2	Q9C040	744 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ABI3	Q9P2A4	366 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PRODH2	Q9UF12	536 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OR2B3	O76000	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	CSTA	P01040	98 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	IFNA6	P05013	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	C1S	P09871	688 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TAS2R38	P59533	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PPP3R1	P63098	170 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	E2F2	Q14209	437 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SMU1	Q2TAY7	513 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	NETO1	Q8TDF5	533 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RIT1	Q92963	219 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423		J3QRK9	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	AHSA1	O95433	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TNFRSF1B	P20333	461 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	AKAP14	Q86UN6	197 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	OR52P1P	Q8NH57	321 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	NR4A3	Q92570	626 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	PCDHGB1	Q9Y5G3	927 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	APOL3	O95236	402 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	BMP2	P12643	396 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	VLDLR	P98155	873 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	LRP8	Q14114	963 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	SDHAF3	Q9NRP4	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPHP4-208	ENST00000478423		A0A075B6Q4	140 aa		13.56	□□□□□ -0.24

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