RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 RCN2Q14257 317 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PGGHGQ32M88 737 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 DCST1Q5T197 706 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 VWA1Q6PCB0 445 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SSX8Q7RTT4 187 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 LRRC6Q86X45 466 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ZNF740Q8NDX6 193 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RAPGEF5Q92565 580 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 BTBD9Q96Q07 612 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 HOMER3Q9NSC5 361 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 GPR52Q9Y2T5 361 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FKBP7Q9Y680 259 aa7.26□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 A0A088AWK7 358 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SLC22A20A6NK97 555 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 HACD1B0YJ81 288 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 E7ENX8 843 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ACSL3O95573 720 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 IFNA16P05015 189 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FBXO45P0C2W1 286 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FCGR2AP12318 317 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 COX7A2P14406 83 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FMO4P31512 558 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 KLK7P49862 253 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 OLR1P78380 273 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SERTAD2Q14140 314 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 TFDP2Q14188 446 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 STRA8Q7Z7C7 330 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RFX6Q8HWS3 928 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ZNF595Q8IYB9 648 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 DIO2Q92813 273 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 TMEM41AQ96HV5 264 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RADILQ96JH8 1075 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 TBL1YQ9BQ87 522 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SLITRK2Q9H156 845 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ISCUQ9H1K1 167 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 MMP27Q9H306 513 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 TAB2Q9NYJ8 693 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 WHRNQ9P202 907 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ZNF148Q9UQR1 794 aa7.25□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PLOD2O00469 737 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 OR1I1O60431 355 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SLC16A8O95907 504 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ZNF23P17027 643 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 CCND1P24385 295 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PSMA3P25788 255 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 NR4A2P43354 598 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 TTPAP49638 278 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 EFNA4P52798 201 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 NAGLUP54802 743 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SIRPAP78324 504 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SRYQ05066 204 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FUT7Q11130 342 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 ASPHQ12797 758 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RPS6KA2Q15349 733 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RPS6KA1Q15418 735 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 NTRK2Q16620 822 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 EIPR1Q53HC9 387 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 PLXDC2Q6UX71 529 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 NPNTQ6UXI9 565 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 BEND4Q6ZU67 534 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 STK32CQ86UX6 486 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 IFNEQ86WN2 208 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 C17orf64Q86WR6 236 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 OR10G3Q8NGC4 313 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 HPS1Q92902 700 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RILPQ96NA2 401 aa7.24□□□□□ -1.25
USP54-211ENST00000474929 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms