RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	VAPA	Q9P0L0	249 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NTM	Q9P121	344 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RP1	P56715	2156 aa		12.02	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A1B0GX78	115 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SGK494	L7N484	410 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PDPK1	O15530	556 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR75	O95800	540 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM1	P13688	526 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GALNS	P34059	522 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HSD17B7	P56937	341 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	HBA1	P69905	142 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	VAC14	Q08AM6	782 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PHF19	Q5T6S3	580 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD26P1	Q6NSI1	321 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM64	Q6YI46	380 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR6C1	Q96RD1	312 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CMKLR1	Q99788	373 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	INPP5K	Q9BT40	448 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	STRADB	Q9C0K7	418 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CMTM6	Q9NX76	183 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	VPS4A	Q9UN37	437 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PLOD2	O00469	737 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLDN4	O14493	209 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RDH16	O75452	317 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CYC1	P08574	325 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	UQCRC2	P22695	453 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ME2	P23368	584 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ALDH9A1	P49189	494 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GZMM	P51124	257 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	XK	P51811	444 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CEACAM7	Q14002	265 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ISX	Q2M1V0	245 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MMP21	Q8N119	569 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZFP90	Q8TF47	636 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	UCN3	Q969E3	161 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MOAP1	Q96BY2	351 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	PRORSD1P	A6NEY8	169 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	EVPLL	A8MZ36	301 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	CLIC1	O00299	241 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	NME4	O00746	187 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	C6orf47	O95873	294 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	MT-CO3	P00414	261 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ALB	P02768	609 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP1B1	P05026	303 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TRAF4-208	ENST00000469529	FH	P07954	510 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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