RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462335.1

PKP4-208, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 4

Gene PKP4, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-208ENST00000462335 ITGAMP11215 1152 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NT5EP21589 574 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MAPK1P28482 360 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 XKP51811 444 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SLC26A5P58743 744 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 FOLH1Q04609 750 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 C2orf80Q0P641 193 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MFAP5Q13361 173 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TLR1Q15399 786 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 GALNTL6Q49A17 601 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ATG16L1Q676U5 607 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HSDL2Q6YN16 418 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TMEM156Q8N614 296 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MORN4Q8NDC4 146 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RIT1Q92963 219 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TMEM125Q96AQ2 219 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 KLHL29Q96CT2 875 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 C5orf34Q96MH7 638 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 BBS4Q96RK4 519 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CCT7Q99832 543 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CNPPD1Q9BV87 410 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ACPTQ9BZG2 426 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SEMA4CQ9C0C4 833 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MCM8Q9UJA3 840 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ASB4Q9Y574 426 aa8.96□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 A0A1B0GTL3 188 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TMPRSS11DO60235 418 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 AIFM1O95831 613 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 DRD2P14416 443 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CD46P15529 392 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.983e-6■■□□□ 13.6
PKP4-208ENST00000462335 GSTM5P46439 218 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 STT3AP46977 705 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SLC1A6P48664 564 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 Q0VFX4 171 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TERF2Q15554 542 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HSP90B2PQ58FF3 399 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ACER2Q5QJU3 275 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PCSK4Q6UW60 755 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SCUBE1Q8IWY4 988 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 OR1N1Q8NGS0 311 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NCLNQ969V3 563 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PPP3R2Q96LZ3 170 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 EBPLQ9BY08 206 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 C1orf109Q9NX04 203 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ZNF225Q9UK10 706 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ERVK-11Q9UQG0 969 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 NUP210LQ5VU65 1888 aa8.95□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 ITPR1Q14643 2758 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 A0A1W2PQ72 361 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 SERTM1A2A2V5 107 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 K7EM74 188 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PGRMC2O15173 223 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 FGF17O60258 216 aa8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
PKP4-208ENST00000462335 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms