RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455877.5

URGCP-208, Transcript of upregulator of cell proliferation, human

TSL 4

Gene URGCP, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
URGCP-208	ENST00000455877	ESAM	Q96AP7	390 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FGF17	O60258	216 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FBXO45	P0C2W1	286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	KCNC1	P48547	511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	STX4	Q12846	297 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	RCN2	Q14257	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	NTNG2	Q96CW9	530 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DERL2	Q9GZP9	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	QPCTL	Q9NXS2	382 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.63	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ATE1	O95260	518 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CLPS	P04118	112 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PEX19	P40855	299 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CASP2	P42575	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	STT3A	P46977	705 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ASCL1	P50553	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	WNT3	P56703	355 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CRYZ	Q08257	329 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	MGAT5	Q09328	741 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CBLB	Q13191	982 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	OR4D1	Q15615	310 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TBCC	Q15814	346 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	LAS2	Q8IYD9	372 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PDIK1L	Q8N165	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SLC15A4	Q8N697	577 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	OR10G3	Q8NGC4	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FAM222B	Q8WU58	562 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	FBXL20	Q96IG2	436 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ZAN	Q9Y493	2812 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877		E7ESA3	106 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	CES2	O00748	559 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	STK16	O75716	305 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	PIAS1	O75925	651 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	EPPIN	O95925	133 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TNNI3	P19429	210 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	DNASE1	P24855	282 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	HOXC12	P31275	282 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	UQCRC1	P31930	480 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	TIMP3	P35625	211 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	HSPA7	P48741	367 aa		11.61	□□□□□ -0.55
URGCP-208	ENST00000455877	ZNF136	P52737	540 aa		11.61	□□□□□ -0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms