RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUV39H1	O43463	412 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SUPT3H	O75486	399 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CAPN1	P07384	714 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	GFAP	P14136	432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	NPPB	P16860	134 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SERPINB1	P30740	379 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	AHR	P35869	848 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PIK3CG	P48736	1102 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	AGTR2	P50052	363 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SERPINB8	P50452	374 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CSRP3	P50461	194 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TAS2R50	P59544	299 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAC3	P60763	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CSNK1G2	P78368	415 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	IRF8	Q02556	426 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAP	Q12884	760 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDC16	Q13042	620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CHAF1B	Q13112	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL10RA	Q13651	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TGFBI	Q15582	683 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	HKDC1	Q2TB90	917 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PLD3	Q8IV08	490 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	IQCK	Q8N0W5	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	GFM2	Q969S9	779 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	RELT	Q969Z4	430 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PYCR2	Q96C36	320 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	REPS1	Q96D71	796 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	LMF1	Q96S06	567 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	OLFM1	Q99784	485 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	LHPP	Q9H008	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CLMP	Q9H6B4	373 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	OPTC	Q9UBM4	332 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	PSAT1	Q9Y617	370 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPTB	P11277	2137 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	FEZF1	A0PJY2	475 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	KRT87P	A6NCN2	255 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	IDS	B3KWA1	339 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550		H3BMH7	237 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDC7	O00311	574 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CLDN4	O14493	209 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMIM24	O75264	130 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALOX12B	O75342	701 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAJB5	O75953	348 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ACSL3	O95573	720 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	MLYCD	O95822	493 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TSPAN12	O95859	305 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	HP	P00738	406 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SERPINA6	P08185	405 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	CELA3B	P08861	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	RBP1	P09455	135 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ALOX12	P18054	663 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TFEB	P19484	476 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	XCR1	P46094	333 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	SOX8	P57073	446 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARG2	P78540	354 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	TLE1	Q04724	770 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SH3BGR-208	ENST00000452550	HGFAC	Q04756	655 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms