RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441099.5

TRAPPC12-209, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 3

Gene TRAPPC12, Length 698 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-209ENST00000441099 MLF1P58340 268 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 FOLH1Q04609 750 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 BIKQ13323 160 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TUBA3CQ13748 450 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 MORN4Q8NDC4 146 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR14A16Q8NHC5 309 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TCP10LQ8TDR4 215 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 VMP1Q96GC9 406 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SMC6Q96SB8 1091 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 DEFB126Q9BYW3 111 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.036e-8■■■■□ 26.5
TRAPPC12-209ENST00000441099 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.85□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CCDC151A5D8V7 595 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GABRR3A8MPY1 467 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 C17orf105B2RV13 164 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 H3BQF6 201 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PRAMEF2O60811 474 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIM13O60858 407 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TNNI3P19429 210 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ALDH3A1P30838 453 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 CD96P40200 585 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 HMGCS1Q01581 520 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SCIMPQ6UWF3 145 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF321PQ8N8H1 164 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 DGAT2Q96PD7 388 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZIM3Q96PE6 472 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 WDR41Q9HAD4 459 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 SENP1Q9P0U3 644 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ABI3Q9P2A4 366 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 TENM4Q6N022 2769 aa14.84□□□□□ -0.03
TRAPPC12-209ENST00000441099 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 CDK2AP1O14519 115 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZFAND5O76080 213 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SERPINB3P29508 390 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 MAPK12P53778 367 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ATCAYQ86WG3 371 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 MDS2Q8NDY4 140 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ZNF721Q8TF20 911 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 APIPQ96GX9 242 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 MECRQ9BV79 373 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 CLMPQ9H6B4 373 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.83□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 A0A1W2PS29 197 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 VPS4BO75351 444 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 NEURL1O76050 574 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 IGKV3-11P04433 115 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SLC35E2P0CK97 266 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 UROSP10746 265 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 ETV4P43268 484 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 PLIN5Q00G26 463 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR1C1Q15619 314 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SPINK14Q6IE38 97 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRIM46Q7Z4K8 759 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 MMP21Q8N119 569 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 GRHL3Q8TE85 626 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 TRMOQ9BU70 441 aa14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC12-209ENST00000441099 OR8D2Q9GZM6 311 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms