RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CENPOQ9BU64 300 aa16.42■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.42■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KRT87PA6NCN2 255 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BM21 787 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC31A1O15431 190 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPN2O95208 641 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GABRB1P18505 474 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPORP19235 508 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACSL1P33121 698 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGFALSP35858 605 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DENND6BQ8NEG7 585 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOXJ1Q92949 421 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNC2Q96PR1 638 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA9Q9BWV2 254 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF167Q9H6Y7 350 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CFL2Q9Y281 166 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SERTM1A2A2V5 107 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FPGTO14772 594 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCN2BO60939 215 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DDOSTP39656 456 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC15A1P46059 708 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNJ10P78508 379 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF367Q7RTV3 350 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GALNT10Q86SR1 603 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR2L2Q8NH16 312 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHTF18Q8WVB6 975 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q96MT0 163 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SNX6Q9UNH7 406 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.41■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARHGEF33A8MVX0 844 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRMT3O60678 531 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTHP01270 115 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1QCP02747 245 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STSP08842 583 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRPS1L1P21108 318 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AP1S2P56377 157 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPR50Q13585 617 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NFE2L1Q14494 772 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRRTM4Q86VH4 590 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DEPDC4Q8N2C3 294 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMCO6Q96DC7 493 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FCRL1Q96LA6 429 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PANX1Q96RD7 426 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC32A1Q9H598 525 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMAN1LQ9HAT1 526 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MGAT4DA6NG13 374 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GUCY1B2O75343 617 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UGT2B17O75795 530 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WNT3P56703 355 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 STX19Q8N4C7 294 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GALNT6Q8NCL4 622 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SIMC1Q8NDZ2 872 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC30A2Q9BRI3 323 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ELOVL6Q9H5J4 265 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C3orf14Q9HBI5 128 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF226Q9NYT6 803 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBC1D24Q9ULP9 559 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa16.4■□□□□ 0.22
USP27X-AS1-201ENST00000437322 A6NL46 340 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SSX4O60224 188 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRATO95237 230 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CATP04040 527 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAPPC2P0DI81 140 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AMD1P17707 334 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BDKRB1P46663 353 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNMTP50135 292 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DGKEP52429 567 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDK10Q15131 360 aa16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF605Q86T29 641 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms