RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR1F2PQ96R84 312 aa10.15□□□□□ -0.78
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APOBEC3C-202ENST00000428892 MS4A8Q9BY19 250 aa10.15□□□□□ -0.78
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNK13Q9HB14 408 aa10.15□□□□□ -0.78
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLDN16Q9Y5I7 305 aa10.13□□□□□ -0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0G2JN53 185 aa10.12□□□□□ -0.79
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGEB17A8MXT2 336 aa10.12□□□□□ -0.79
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APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP6CO00743 305 aa10.12□□□□□ -0.79
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