RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGTR2P50052 363 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ARFIP1P53367 373 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ISL1P61371 349 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKCDQ05655 676 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CD47Q08722 323 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 VAC14Q08AM6 782 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATG9BQ674R7 924 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF544Q6NX49 715 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DHRS13Q6UX07 377 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 STK32CQ86UX6 486 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF547Q8IVP9 402 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NATD1Q8N6N6 113 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLA2G15Q8NCC3 412 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC9Q92623 222 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 TP53INP1Q96A56 240 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CMTM7Q96FZ5 175 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF145Q96MT1 663 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MBOAT4Q96T53 435 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SGPP1Q9BX95 441 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DUSP21Q9H596 190 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MARCH7Q9H992 704 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PELI2Q9HAT8 420 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AIG1Q9NVV5 245 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KLQ9UEF7 1012 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR45Q9Y5Y3 372 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.51□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A087WV48 116 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 G3V2T6 193 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC31A1O15431 190 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 INMTO95050 263 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PIK3CBP42338 1070 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASMTP46597 345 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GNG2P59768 71 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 E2F1Q01094 437 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP4F3Q08477 520 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKG2Q13237 762 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NAE1Q13564 534 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NR6A1Q15406 480 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGAP6Q5VW22 663 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRG2Q64ET8 278 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLEC6AQ6EIG7 209 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MED27Q6P2C8 311 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOK6Q6PKX4 331 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 USP43Q70EL4 1123 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 HID1Q8IV36 788 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 EID2Q8N6I1 236 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SELENOMQ8WWX9 145 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FCGR1BQ92637 280 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PROX1Q92786 737 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C3orf30Q96M34 536 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 AGAP4Q96P64 663 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 QRFPRQ96P65 431 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FRG2BQ96QU4 278 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKP4Q99569 1192 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf109Q9NX04 203 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF221Q9UK13 617 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.5□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0G2JNG1 304 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM234BA2RU67 622 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 MANBAO00462 879 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 GUCY1B2O75343 617 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKD3O94806 890 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC16A8O95907 504 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 APOA1P02647 267 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IL1RNP18510 177 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 IMPA1P29218 277 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PREPP48147 710 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRIM2P49643 509 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB28P51157 221 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP2CBP62714 309 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP2CAP67775 309 aa9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
APOBEC3G-201ENST00000407997 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms