RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR2L5Q8NG80 312 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM110BQ8TC76 370 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SLC37A2Q8TED4 501 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RSC1A1Q92681 617 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D20Q96BZ9 403 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PPCDCQ96CD2 204 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HRASLS5Q96KN8 279 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF597Q96LX8 424 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KCNC2Q96PR1 638 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR2A5Q96R48 311 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CENPKQ9BS16 269 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TBCDQ9BTW9 1192 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC61Q9BV99 259 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TPSD1Q9BZJ3 242 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TPT1P8Q9HAU6 139 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C8orf4Q9NR00 106 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GPATCH2Q9NW75 528 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ACTR10Q9NZ32 417 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 VPS4AQ9UN37 437 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ASB4Q9Y574 426 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CACNA1AO00555 2505 aa5.71□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR5K3A6NET4 321 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C2orf74A8MZ97 194 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ISM1B1AKI9 464 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UPK1AO00322 258 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RTCAO00442 366 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 DPM1O60762 260 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CTSVO60911 334 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NDUFS2O75306 463 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TIPRLO75663 272 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 C6orf47O95873 294 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 VIPP01282 170 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GBAP04062 536 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RAP2AP10114 183 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TDGF1P13385 188 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UQCRBP14927 111 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FASP25445 335 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PCGF2P35227 344 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA2P43356 314 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MAGEA8P43361 318 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CXCL12P48061 93 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 LSSP48449 732 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HSPA13P48723 471 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CLCN2P51788 898 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 AQP4P55087 323 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NXPH1P58417 271 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RBBP4Q09028 425 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FADDQ13158 208 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 HEPACAMQ14CZ8 416 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RGNQ15493 299 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CEBPEQ15744 281 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NKG7Q16617 165 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 VMACQ2NL98 169 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MANEAQ5SRI9 462 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SAXO2Q658L1 398 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SPESP1Q6UW49 350 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM26Q6ZUK4 368 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC80Q76M96 950 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 RNF44Q7L0R7 432 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 TAF8Q7Z7C8 310 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 EPHX4Q8IUS5 362 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PLD3Q8IV08 490 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 MMP21Q8N119 569 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ACOT4Q8N9L9 421 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR52N2Q8NGI0 321 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 PATE1Q8WXA2 126 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 SNX19Q92543 992 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CHID1Q9BWS9 393 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 UGT2B28Q9BY64 529 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 ABCG4Q9H172 646 aa5.7□□□□□ -1.5
C6orf48-208ENST00000395788 KLHL31Q9H511 634 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms