RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 LGI4Q8N135 537 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 WDSUB1Q8N9V3 476 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RHOVQ96L33 236 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CACNG6Q9BXT2 260 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 FXYD6Q9H0Q3 95 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ASB1Q9Y576 335 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 KCTD3Q9Y597 815 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BTAF1O14981 1849 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR6C68A6NDL8 312 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 B4GALT5O43286 388 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CCNDBP1O95273 360 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TCRBP04435 133 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SMIM6P0DI80 62 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.14□□□□□ -0.954e-6■■■■□ 24.4
TMOD1-203ENST00000395211 CNR2P34972 360 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PCP4P48539 62 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SLC14A1Q13336 389 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MBTPS1Q14703 1052 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MPPE1Q53F39 396 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 IDNKQ5T6J7 187 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 EEF1DP3Q658K8 133 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TRPV1Q8NER1 839 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PMM1Q92871 262 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 JAM3Q9BX67 310 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MBD2Q9UBB5 411 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 LRIT2A6NDA9 550 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 I6L893 689 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GPR37O15354 613 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PAGE1O75459 146 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 AKR7A3O95154 331 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SOX14O95416 240 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PRR35P0CG20 571 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PTPN6P29350 595 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RFC3P40938 356 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 BDKRB1P46663 353 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR2B11Q5JQS5 317 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ACER2Q5QJU3 275 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 AVPI1Q5T686 147 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 FAHD1Q6P587 224 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF614Q8N883 585 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 THAP6Q8TBB0 222 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 SCMH1Q96GD3 660 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 OR2M2Q96R28 347 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PORCNQ9H237 461 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PHF11Q9UIL8 331 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GABRR3A8MPY1 467 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 C2orf74A8MZ97 194 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 FAM220BPB1ANY3 271 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CD3GP09693 182 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PAICSP22234 425 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CDKN2CP42773 168 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 HSPA7P48741 367 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 EVX1P49640 407 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ARSDP51689 593 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ITGA1P56199 1179 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 IKZF1Q13422 519 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PGM5Q15124 567 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 XKR7Q5GH72 579 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 RAET1GQ6H3X3 334 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 USP53Q70EK8 1073 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD1-203ENST00000395211 CLDN22Q8N7P3 220 aa9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms