RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 UCKL1Q9NWZ5 548 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NPIPA1Q9UND3 350 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6C70A6NIJ9 312 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 WASH4PA8MWX3 477 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF432O94892 652 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMBIM6P55061 237 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DEFB103AP81534 67 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MAPK14Q16539 360 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PMM1Q92871 262 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB28P51157 221 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DNM1P34Q6PK57 102 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC39A11Q8N1S5 342 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 MINDY2Q8NBR6 621 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR52P1PQ8NH57 321 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FANK1Q8TC84 345 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 F8A1P23610 371 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0319Q5VV43 1072 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FRS2Q8WU20 508 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NR4A3Q92570 626 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LGALS12Q96DT0 336 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM19Q96HH6 336 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 C3orf30Q96M34 536 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CASD1Q96PB1 797 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CLSTN3Q9BQT9 956 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 METTL7AQ9H8H3 244 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HCRTR2O43614 444 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 IL1RNP18510 177 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RHCEP18577 417 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HRH2P25021 359 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SOX2P48431 317 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 FIGNL1Q6PIW4 674 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR8K3Q8NH51 312 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD6Q8TBK2 473 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ARNT2Q9HBZ2 717 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PRG6 482 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 HSD11B1P28845 292 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NTSR1P30989 418 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GCGRP47871 477 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 VEGFBP49765 207 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.236e-7■□□□□ 11.1
SH3BP4-202ENST00000392011 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 NAGSQ8N159 534 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 VAPAQ9P0L0 249 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP6V1G1O75348 118 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 BMP2P12643 396 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP16.46■□□□□ 0.239e-7■■■■□ 19.6
SH3BP4-202ENST00000392011 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 GRIN2CQ14957 1233 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC80Q76M96 950 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR2T33Q8NG76 320 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6N1Q8NGY5 312 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 AASSQ9UDR5 926 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 CHD4Q14839 1912 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-202ENST00000392011 RPS17P08708 135 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C12orf40Q86WS4 652 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC46A2Q9BY10 475 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CAPN14A8MX76 684 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PGAM2P15259 253 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGDIBP52566 201 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM15Q13444 863 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 ELOCQ15369 112 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CENPSQ8N2Z9 138 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MYLIPQ8WY64 445 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C20orf27Q9GZN8 174 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 C11orf98E9PRG8 122 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 GALNT12Q8IXK2 581 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP76Q8TAP6 659 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 LRR1Q96L50 414 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP27Q9H306 513 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-202ENST00000392011 DRD2P14416 443 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms