RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CRYGNQ8WXF5 182 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PGM2Q96G03 612 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPATA17Q96L03 361 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LINC00477Q96M19 166 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PAFAH2Q99487 392 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FEVQ99581 238 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CPNE1Q99829 537 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GLIPR2Q9H4G4 154 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IL1RL2Q9HB29 575 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACEP12821 1306 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GSAPA4D1B5 854 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR2A25A4D2G3 310 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A6NDX4 124 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RNF212BA8MTL3 300 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM77I1YAP6 450 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC17A2O00624 439 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IMPA2O14732 288 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 P2RX6O15547 441 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SUPT7LO94864 414 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGHV4-34P06331 123 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PYGLP06737 847 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZCCHC18P0CG32 403 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LAMP2P13473 410 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYP11B1P15538 503 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PFKFB1P16118 471 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 XBP1P17861 261 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYP11B2P19099 503 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IDSP22304 550 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PPP2R1AP30153 589 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GARSP41250 739 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NRIP1P48552 1158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CCR6P51684 374 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF75DP51815 510 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARHGDIBP52566 201 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UCP2P55851 309 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNTN1Q12860 1018 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RASA2Q15283 850 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTGISQ16647 500 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ODF2Q5BJF6 829 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IGSF11Q5DX21 431 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR52W1Q6IF63 320 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IKBIPQ70UQ0 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF429Q86V71 674 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 UNC5CLQ8IV45 518 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GCNT2Q8N0V5 402 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C6orf223Q8N319 242 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC43A2Q8N370 569 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q8N9W7 124 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR10S1Q8NGN2 331 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATL1Q8WXF7 558 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LPGAT1Q92604 370 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FRZBQ92765 325 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM63Q969Q1 353 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RAB3CQ96E17 227 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TSNARE1Q96NA8 513 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCGF6Q9BYE7 350 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 Q9H3A6 140 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MMP26Q9NRE1 261 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 IRAK4Q9NWZ3 460 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PSD3Q9NYI0 1048 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RRN3Q9NYV6 651 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GMEB2Q9UKD1 530 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 USP24Q9UPU5 2620 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LAMB2P55268 1798 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CACNA1GO43497 2377 aa-0.1□□□□□ -2.42
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRABD2BA6NFA1 517 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A6NLC8 198 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms