RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384114.1

RNU6-409P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 409, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-409P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-409P-201ENST00000384114 IGHV4-34P06331 123 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CCDC166P0CW27 439 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CYP11B1P15538 503 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PFKFB1P16118 471 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TM4SF1P30408 202 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GARSP41250 739 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RPS9P46781 194 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RXRGP48443 463 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LCP2Q13094 533 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 UNC119Q13432 240 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 BIRC3Q13489 604 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RBBP7Q16576 425 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PTGISQ16647 500 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TSTQ16762 297 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PLPP4Q5VZY2 271 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FAM219BQ5XKK7 198 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GALNT17Q6IS24 598 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TTC27Q6P3X3 843 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 IKBIPQ70UQ0 350 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PIGWQ7Z7B1 504 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 Q8N9W7 124 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ZBTB44Q8NCP5 570 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 OR10H4Q8NGA5 316 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SCFD2Q8WU76 684 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RFFLQ8WZ73 363 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SMPDL3AQ92484 453 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PAFAH2Q99487 392 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CPNE1Q99829 537 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 DPH7Q9BTV6 452 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SPNS1Q9H2V7 528 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 Q9H3A6 140 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GORASP2Q9H8Y8 452 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 IL1RL2Q9HB29 575 aa-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LRP4O75096 1905 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TMCO5BA8MYB1 307 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TRIM77I1YAP6 450 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC17A2O00624 439 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 IMPA2O14732 288 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PLOD3O60568 738 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC2A10O95528 541 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LINGO3P0C6S8 592 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 P0C880 135 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CT45A10P0DMU9 189 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RNH1P13489 461 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ACP1P24666 158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CCNCP24863 283 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ID1P41134 155 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TFPI2P48307 235 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NRIP1P48552 1158 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ARHGDIBP52566 201 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GGTLC2Q14390 218 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 BECN1Q14457 450 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MAPK11Q15759 364 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FAM83EQ2M2I3 478 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ZNF674Q2M3X9 581 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CBWD6Q4V339 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ODF2Q5BJF6 829 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CBWD3Q5JTY5 395 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FUT10Q6P4F1 479 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ZNF429Q86V71 674 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 C6orf223Q8N319 242 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CCDC63Q8NA47 563 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SUMF2Q8NBJ7 301 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CAMKVQ8NCB2 501 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CFAP61Q8NHU2 1237 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TMEM101Q96IK0 257 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SPATA17Q96L03 361 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NICN1Q9BSH3 213 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 DPEP3Q9H4B8 488 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 JMJD4Q9H9V9 463 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 IRAK4Q9NWZ3 460 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RRN3Q9NYV6 651 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RAI14Q9P0K7 980 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa-0.09□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-409P-201ENST00000384114 A6NLC8 198 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-409P-201ENST00000384114 C16orf90A8MZG2 172 aa-0.1□□□□□ -2.43
RNU6-409P-201ENST00000384114 WWP2O00308 870 aa-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms