RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 RGRP47804 291 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFCP2Q12800 502 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ODF2Q5BJF6 829 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 CGB2Q6NT52 195 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 PET117Q6UWS5 81 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 THNSL1Q8IYQ7 743 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ICA1LQ8NDH6 482 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 NTNG2Q96CW9 530 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERO1AQ96HE7 468 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCED1BQ96HM7 432 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ASB8Q9H765 288 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADAM22Q9P0K1 906 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1A2Q9Y585 309 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.16□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATRXP46100 2492 aa2.15□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa2.15□□□□□ -2.06
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEB16A2A368 324 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYT7O43581 403 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PGAM2P15259 253 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOSL2P15408 326 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGMTP16455 207 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GDF1P27539 372 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MDH2P40926 338 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCNJ1P48048 391 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MEOX2P50222 304 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R3AQ16821 1122 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANKRD55Q3KP44 614 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C14orf28Q4W4Y0 310 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 C2orf83Q53S99 150 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARL14Q8N4G2 192 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF525Q8N782 197 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1K1Q8NGR3 316 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA18Q8TC71 538 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 NUS1Q96E22 293 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL1RL2Q9HB29 575 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 AMBNQ9NP70 447 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TAS2R16Q9NYV7 291 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPG21Q9NZD8 308 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 VPS18Q9P253 973 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPR132Q9UNW8 380 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACEP12821 1306 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FER1L5A0AVI2 2057 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCT8L1PA6NM43 557 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDAC3O15379 428 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSC22D2O75157 780 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANXA9O76027 345 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRAMEF12O95522 483 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC159P0C7I6 412 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 P4HA1P13674 534 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CD1EP15812 388 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGEA9P43362 315 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCR4P51679 360 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC25A1P53007 311 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPY1Q01534 308 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC34A1Q06495 639 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCN1BQ07699 218 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 KCTD2Q14681 263 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPHARQ15513 63 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACKR1Q16570 336 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 AGAP6Q5VW22 663 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PODNL1Q6PEZ8 512 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAPH1Q70E73 1250 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF671Q8TAW3 534 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 AFAP1L1Q8TED9 768 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM162AQ96A26 154 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB40CQ96S21 281 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RASL10BQ96S79 203 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 WWP1Q9H0M0 922 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRD5A3Q9H8P0 318 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 VNN3Q9NY84 501 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7ERI5 159 aa2.13□□□□□ -2.07
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC30A4O14863 429 aa2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms