RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBP1Q9H171 429 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIS18AQ9NYP9 233 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEPT10Q9P0V9 454 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB9Q9UBS3 223 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NRBP1Q9UHY1 535 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FBXL5Q9UKA1 691 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM149AA5PLN7 773 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YIG0 161 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 E2F3O00716 465 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA0513O60268 411 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RHBDL1O75783 438 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANXA9O76027 345 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 LY6G6DO95868 133 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC16A8O95907 504 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCGR3AP08637 254 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSD17B1P14061 328 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOSL2P15408 326 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CALML3P27482 149 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEB1P43366 347 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 HMGCS2P54868 508 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL27P61353 136 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDPQ00604 133 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC34A1Q06495 639 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEF2DQ14814 521 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC17A1Q14916 467 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPHARQ15513 63 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF12Q5T6F0 453 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF600Q6ZNG1 722 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOOK3Q86VS8 718 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf64Q86WR6 236 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 NAXDQ8IW45 347 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUSC5Q8IXB3 177 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 GVQW1Q8N7I0 195 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q8N7P7 452 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1K1Q8NGR3 316 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEKT1Q969V4 418 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ULK4Q96C45 1275 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP2M1Q96CW1 435 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R16AQ96I34 528 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZIM3Q96PE6 472 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 RANBP9Q96S59 729 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 SSX3Q99909 188 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 WWP1Q9H0M0 922 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPEP3Q9H4B8 488 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABCC13Q9NSE7 274 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITM2BQ9Y287 266 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1A2Q9Y585 309 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACEP12821 1306 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF212BA8MTL3 300 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMA7O14818 248 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHG3P01860 377 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC159P0C7I6 412 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPX3P22352 226 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP2R1BP30154 601 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHRNA3P32297 505 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 EMC2Q15006 297 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTB4RQ15722 352 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC158Q5M9N0 1113 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf189Q5VU69 101 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAMR1Q6UXH9 720 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZRG5 221 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTOAQ7RTW8 1153 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR49Q8IV35 697 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF491Q8N8L2 437 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPV3Q8NET8 790 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA5Q8TBA6 731 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTSF1Q8WW33 167 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 GGHQ92820 318 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 BADQ92934 168 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf58Q96GQ5 468 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYYR1Q96J86 154 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GALT6Q96L58 329 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 PANX3Q96QZ0 392 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-552P-201ENST00000362869 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms