RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354513.9

PDGFA-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit A, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFA, Length 1,308 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFA-201ENST00000354513 IRF8Q02556 426 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 PCDH1Q08174 1060 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 STX4Q12846 297 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 LAPTM5Q13571 262 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 RGS9BPQ6ZS82 235 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 ISCA2Q86U28 154 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.66□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 TBCDQ9BTW9 1192 aa14.66□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.66□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 OR14I1A6ND48 311 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 HPDP32754 393 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDGFA-201ENST00000354513 ADH7P40394 386 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 Q9UFV3 132 aa14.65□□□□□ -0.06
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PDGFA-201ENST00000354513 MPEG1Q2M385 716 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 PAOXQ6QHF9 649 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 OPN5Q6U736 354 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 CYS1Q717R9 158 aa14.64□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 NUBPLQ8TB37 319 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 ERP44Q9BS26 406 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 KCNJ16Q9NPI9 418 aa14.64□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 K7EPI3 171 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 ATP6AP2O75787 350 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 SLU7O95391 586 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 TNNI3P19429 210 aa14.63□□□□□ -0.07
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PDGFA-201ENST00000354513 SSR2P43308 183 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 SLC7A5Q01650 507 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 TNFRSF17Q02223 184 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 FOLH1Q04609 750 aa14.63□□□□□ -0.07
PDGFA-201ENST00000354513 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.63□□□□□ -0.07
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