RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000346501.8

TSPAN4-201, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TSPAN4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-201ENST00000346501 ANKRD10Q9NXR5 420 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PSME2Q9UL46 239 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.71□□□□□ -0.05
TSPAN4-201ENST00000346501 FGF17O60258 216 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 PLIN3O60664 434 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ETHE1O95571 254 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 GPR75O95800 540 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 PROCP04070 461 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 UQCRFS1P47985 274 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 HLCSP50747 726 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SSR4P51571 173 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ID2Q02363 134 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 C18orf63Q68DL7 685 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC25A25Q6KCM7 469 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 METTL4Q8N3J2 472 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 CAVIN3Q969G5 261 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 KLHL1Q9NR64 748 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ASB4Q9Y574 426 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ESPL1Q14674 2120 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 GOLGA6L10A6NI86 522 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MANBAO00462 879 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 PPP6CO00743 305 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TMPRSS11DO60235 418 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ITGA10O75578 1167 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC25A12O75746 678 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 CBX6O95503 412 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ESRRBO95718 433 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 GBAP04062 536 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SP1P08047 785 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NAGLUP54802 743 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 DNAJB13P59910 316 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 RBPJQ06330 500 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 IMPG1Q17R60 797 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SPINK14Q6IE38 97 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 OR8K3Q8NH51 312 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ASB15Q8WXK1 588 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NR4A3Q92570 626 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SMC6Q96SB8 1091 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NTNG1Q9Y2I2 539 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 A0A1W2PR48 441 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 C1orf226A1L170 272 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 GLOD5A6NK44 160 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 A8MVJ9 347 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 AIFM1O95831 613 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SPIN4Q56A73 249 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 LIPMQ5VYY2 423 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SLC29A4Q7RTT9 530 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 MDS2Q8NDY4 140 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 RIT1Q92963 219 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 APOPT1Q96IL0 206 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 NPAS2Q99743 824 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 CNPPD1Q9BV87 410 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN4-201ENST00000346501 HPF1Q9NWY4 346 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms