RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 KCNK12Q9HB15 430 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 VAPAQ9P0L0 249 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PQ72 361 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 C9J4A7 227 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MYF6P23409 242 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MAP3K8P41279 467 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF234Q14588 700 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CLEC14AQ86T13 490 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 FANK1Q8TC84 345 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 FEVQ99581 238 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SDC1P18827 310 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 LBX1P52954 281 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR12D2P58182 307 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MC1RQ01726 317 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 YIPF7Q8N8F6 280 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TMEM19Q96HH6 336 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NTMT1Q9BV86 223 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CCRL2O00421 344 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ARL6IP5O75915 188 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 HK1P19367 917 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CD47Q08722 323 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CBLBQ13191 982 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 FAM180BQ6P0A1 224 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 LIPIQ6XZB0 460 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ASB18Q6ZVZ8 466 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 DMRTB1Q96MA1 342 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MARCH5Q9NX47 278 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ITGB7P26010 798 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR5M3Q8NGP4 307 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 FOXJ1Q92949 421 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 UBXN10Q96LJ8 280 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TOX2Q96NM4 488 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZIC5Q96T25 663 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ASPNQ9BXN1 380 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SEC14L4Q9UDX3 406 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NPC1O15118 1278 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TIMP2P16035 220 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 HLA-FP30511 346 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CLCN2P51788 898 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR52E8Q6IFG1 317 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR51G2Q8NGK0 314 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR52P1PQ8NH57 321 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZFAND2BQ8WV99 257 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SLC29A1Q99808 456 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PSMD9O00233 223 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 RETP07949 1114 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NAGSQ8N159 534 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TEX26Q8N6G2 289 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 BRD7Q9NPI1 651 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TMEM184CQ9NVA4 438 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SMIM30A4D0T7 59 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CKMT1AP12532 417 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 GP1BBP13224 206 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CTSCP53634 463 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TAS2R38P59533 333 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 RGNQ15493 299 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NIPAL1Q6NVV3 410 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 C1orf216Q8TAB5 229 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 DOK4Q8TEW6 326 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ECHDC3Q96DC8 303 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ACPTQ9BZG2 426 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 BRF2Q9HAW0 419 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 KLRF1Q9NZS2 232 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 GMEB2Q9UKD1 530 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF726A6NNF4 738 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF879B4DU55 563 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 DNAJB5O75953 348 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 GSTT2BP0CG30 244 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MGAT3Q09327 533 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 WDR45BQ5MNZ6 344 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF367Q7RTV3 350 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ZNF550Q7Z398 422 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SLC22A16Q86VW1 577 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 SHKBP1Q8TBC3 707 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PTCHD1Q96NR3 888 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 C5AR2Q9P296 337 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ABI3Q9P2A4 366 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PIAS3Q9Y6X2 628 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 A0A1W2PRQ8 180 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NUAK1O60285 661 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 CTC1Q2NKJ3 1217 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR4N5Q8IXE1 308 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 NEIL2Q969S2 332 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PELI2Q9HAT8 420 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 TMEM236Q5W0B7 351 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 OR8J1Q8NGP2 316 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 KCNN1Q92952 543 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 PRODH2Q9UF12 536 aa19.8■□□□□ 0.76
NISCH-201ENST00000345716 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms