RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344376.9

ATG4B-201, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 1,566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-201ENST00000344376 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 OR5L2Q8NGL0 311 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ART5Q96L15 291 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 NMRK1Q9NWW6 199 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ATG4B-201ENST00000344376 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ASPDHA6ND91 283 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TMPRSS11DO60235 418 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NME2P1O60361 137 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 UNC5CO95185 931 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KRT15P19012 456 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TSPAN8P19075 237 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 NME2P22392 152 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KCNK10P57789 538 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FOLH1Q04609 750 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RASA2Q15283 850 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR4N5Q8IXE1 308 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR8K3Q8NH51 312 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ADAM29Q9UKF5 820 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ASB4Q9Y574 426 aa14.95□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1B0GUH1 482 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A8MVJ9 347 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR10H2O60403 315 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 DLX3O60479 287 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GLRA3O75311 464 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 AIFM1O95831 613 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KRT6AP02538 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KRT6BP04259 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MST1P26927 711 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HSD17B3P37058 310 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLCO1A2P46721 670 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KRT6CP48668 564 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 11.1
ATG4B-201ENST00000344376 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MZB1Q8WU39 189 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ASB15Q8WXK1 588 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC126Q96EE4 140 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TMEM237Q96Q45 408 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF382Q96SR6 550 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 BRF2Q9HAW0 419 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 13
ATG4B-201ENST00000344376 HPF1Q9NWY4 346 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MYOTQ9UBF9 498 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 A0A1W2PR48 441 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SMIM23A6NLE4 172 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LRRTM2O43300 516 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GUCY1B2O75343 617 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR2J2O76002 312 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GPR75O95800 540 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LDLRP01130 860 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GBAP04062 536 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 SHBGP04278 402 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KLK1P06870 262 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 STSP08842 583 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 IMPDH1P20839 514 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PRKAA2P54646 552 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 UNC50Q53HI1 259 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 KRTCAP3Q53RY4 240 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 TDRPQ86YL5 185 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 FRMD6Q96NE9 622 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 COL12A1Q99715 3063 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCDC151A5D8V7 595 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 GLOD5A6NK44 160 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 WWP2O00308 870 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PPP6CO00743 305 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 OR4F21O95013 312 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 PDYNP01213 254 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MYL2P10916 166 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 ZNF24P17028 368 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 HMOX2P30519 316 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CCT5P48643 541 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 MAPK12P53778 367 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 CASP6P55212 293 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 RNF4P78317 190 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 LCP2Q13094 533 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-201ENST00000344376 METTL4Q8N3J2 472 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms