RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.08■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 FGF17O60258 216 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PEX11AO75192 247 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 VPS4BO75351 444 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ATP6AP2O75787 350 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 IFNA16P05015 189 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PIK3R1P27986 724 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MAPK1P28482 360 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TERF2Q15554 542 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 EXT1Q16394 746 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SMU1Q2TAY7 513 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 KBTBD2Q8IY47 623 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 GALNT16Q8N428 558 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 OR4K14Q8NGD5 310 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 FCRL1Q96LA6 429 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 C7orf26Q96N11 449 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM55Q9BYV6 548 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TRPC5OSA6NMA1 111 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TGFBR3LH3BV60 316 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 HDAC3O15379 428 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 RPL38P63173 70 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PLAG1Q6DJT9 500 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SLC48A1Q6P1K1 146 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 OR4N5Q8IXE1 308 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 M1APQ8TC57 530 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TUBD1Q9UJT1 453 aa25.06■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 CEACAM4O75871 244 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SERPINA7P05543 415 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 IL3P08700 152 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SFTPCP11686 197 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 COX7A2P14406 83 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 IKBIPQ70UQ0 350 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 UCN3Q969E3 161 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 DGAT2Q96PD7 388 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 NUF2Q9BZD4 464 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 LHPPQ9H008 270 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MEAF6Q9HAF1 191 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MYNNQ9NPC7 610 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 CES1P1Q9UKY3 287 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa25.05■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 WASHC1A8K0Z3 465 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 A8MUA0 341 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB5O75953 348 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 JUNP05412 331 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 KITP10721 976 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 TNNI3P19429 210 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA3P26006 1051 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 STT3AP46977 705 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ALDH9A1P49189 494 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ID2Q02363 134 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 C2orf80Q0P641 193 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 BTBD16Q32M84 506 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 RGS9BPQ6ZS82 235 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 FNDC5Q8NAU1 212 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 EHD3Q9NZN3 535 aa25.04■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 NBEAQ8NFP9 2946 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 A6NL46 340 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MASP2O00187 686 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PRR35P0CG20 571 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SLC35E2P0CK97 266 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 GALNSP34059 522 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 ASMTP46597 345 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 XKP51811 444 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SLC26A5P58743 744 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PLIN5Q00G26 463 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 Q0VFX4 171 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 MYBPC3Q14896 1274 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 FAM71E1Q6IPT2 247 aa25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms