RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299353.6

BORCS7-ASMT-201, Transcript of BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene BORCS7-ASMT, Length 2,670 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DOC2AQ14183 400 aa6.66□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GPR33Q49SQ1 333 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TPGS2Q68CL5 300 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CCDC190Q86UF4 302 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ADHFE1Q8IWW8 467 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DTX3Q8N9I9 347 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ATG16L2Q8NAA4 619 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CCDC115Q96NT0 180 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KCNC2Q96PR1 638 aa6.66□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 A0A096LPI6 279 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ARHGEF9O43307 516 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PCDH7O60245 1069 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SOCS5O75159 536 aa6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CTSLP07711 333 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TYRP14679 529 aa6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 WNT3P56703 355 aa6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TEAD2Q15562 447 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 MPPE1Q53F39 396 aa6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 XKRXQ6PP77 449 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ITPAQ9BY32 194 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 KCNH6Q9H252 994 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SPG21Q9NZD8 308 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CKAP5Q14008 2032 aa6.65□□□□□ -1.34
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.65□□□□□ -1.35
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BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SCO1O75880 301 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 OLFM2O95897 454 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TGFB1P01137 390 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 LCKP06239 509 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PSKH1P11801 424 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HLA-EP13747 358 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 PTGER1P34995 402 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 IL12RB1P42701 662 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SLC6A12P48065 614 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 CREMQ03060 361 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ACSM2AQ08AH3 577 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 TNK1Q13470 666 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SYT16Q17RD7 645 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 DEFB115Q30KQ5 88 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 RFX4Q33E94 735 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HTR3DQ70Z44 454 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 AHSA2Q719I0 299 aa6.65□□□□□ -1.35
BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.65□□□□□ -1.35
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