RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 COX4I1P13073 169 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 DGKQP52824 942 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SLC25A3Q00325 362 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PDE7AQ13946 482 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PRSS53Q2L4Q9 553 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 OR52E8Q6IFG1 317 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 DSELQ8IZU8 1212 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FAM47BQ8NA70 645 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 OR51Q1Q8NH59 317 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TESCQ96BS2 214 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PEX11GQ96HA9 241 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 MIEF1Q9NQG6 463 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 MAPRE3Q9UPY8 281 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SPACA6W5XKT8 324 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FRYQ5TBA9 3013 aa16.76■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FER1L5A0AVI2 2057 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TRABD2BA6NFA1 517 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 C9orf172C9J069 976 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 NR5A2O00482 541 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 KRT34O76011 436 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 LAMP1P11279 417 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 COX7A2P14406 83 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ABHD18Q0P651 414 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CCNIQ14094 377 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RCAN2Q14206 197 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PGS1Q32NB8 556 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SNX32Q86XE0 403 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TICAM1Q8IUC6 712 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM52Q8NDY8 209 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 STARD8Q92502 1023 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PPCDCQ96CD2 204 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 MTERF3Q96E29 417 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ECSITQ9BQ95 431 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 C5AR2Q9P296 337 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 C1orf226A1L170 272 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 MEN1O00255 615 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PEX1O43933 1283 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TNFSF15O95150 251 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RPL3P39023 403 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 KCNK10P57789 538 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 DCDP81605 110 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF385BQ569K4 471 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CPTPQ5TA50 214 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 COX15Q7KZN9 410 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CAMKMTQ7Z624 323 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 VPS33AQ96AX1 596 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 COQ8BQ96D53 544 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RBCK1Q9BYM8 510 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 NRSN2Q9GZP1 204 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 WDR41Q9HAD4 459 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SCOCQ9UIL1 159 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CES1P1Q9UKY3 287 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TBX19O60806 448 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 STK17BO94768 372 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ONECUT2O95948 504 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 IL6P05231 212 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CAPN3P20807 821 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 XCR1P46094 333 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 GABREP78334 506 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 PHC1P78364 1004 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ERV3-1Q14264 604 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM164Q5U3C3 297 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 LCN10Q6JVE6 187 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 SLC48A1Q6P1K1 146 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa16.74■□□□□ 0.27
CCDC78-201ENST00000293889 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms