RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264187.6

NID1-201, Transcript of nidogen 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NID1, Length 5,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1-201ENST00000264187 MRIQ9BWK5 157 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CD244Q9BZW8 370 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DNAJB4Q9UDY4 337 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ERP29P30040 261 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ELP2Q6IA86 826 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GKN2Q86XP6 184 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 FRZBQ92765 325 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TUBA1CQ9BQE3 449 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EBLN1P0CF75 366 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TYRP14679 529 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EPHA1P21709 976 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 RNF39Q9H2S5 420 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PXDNQ92626 1479 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 UNC119BA6NIH7 251 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SEC14L5O43304 696 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GRID2O43424 1007 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 IL7P13232 177 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ETV5P41161 510 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 KCNAB2Q13303 367 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 HYAL4Q2M3T9 481 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF516Q92618 1163 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SLIT1O75093 1534 aa14.5□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DFNA5O60443 496 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 IFNA4P05014 189 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 IL3P08700 152 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 NFATC4Q14934 902 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TEAD2Q15562 447 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CES4AQ5XG92 561 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MTG2Q9H4K7 406 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 LILRB5O75023 590 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CBSLP0DN79 551 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CBSP35520 551 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CTBP2P56545 445 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 UGT2A3Q6UWM9 527 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SLC35B2Q8TB61 432 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MOCOSQ96EN8 888 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF599Q96NL3 588 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MYNNQ9NPC7 610 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 LRFN1Q9P244 771 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ADH6P28332 368 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GRIA2P42262 883 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PIGGQ5H8A4 983 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 RAET1LQ5VY80 246 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SLC27A4Q6P1M0 643 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 OR2T33Q8NG76 320 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 TWNKQ96RR1 684 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 MADDQ8WXG6 1647 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 DIP2AQ14689 1571 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 PFKLP17858 780 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CHMP24386 653 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 AQP2P41181 271 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 RSU1Q15404 277 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 NTRK2Q16620 822 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ZNF529Q6P280 563 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 GID4Q8IVV7 300 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ESX1Q8N693 406 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 OR7G2Q8NG99 324 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 ABCG5Q9H222 651 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 SIX2Q9NPC8 291 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 HTR2BP41595 481 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 EMX2Q04743 252 aa14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
NID1-201ENST00000264187 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms