RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637548.1

ARID1B-226, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

Gene ARID1B, Length 2,255 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-226	ENST00000637548	MED25	Q71SY5	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MMP21	Q8N119	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MSANTD3	Q96H12	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IL22	Q9GZX6	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	VPS18	Q9P253	973 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PCYT1B	Q9Y5K3	369 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548		R4GN57	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HEATR9	A2RTY3	570 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MROH6	A6NGR9	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GOLGA8R	I6L899	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	QSOX1	O00391	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC30A4	O14863	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DNAJB5	O75953	348 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	HAUS5	O94927	633 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SEMA4F	O95754	770 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TTC4	O95801	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CHEK2	O96017	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GRP	P07492	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CCDC166	P0CW27	439 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PGAM1	P18669	254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ITIH1	P19827	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CPOX	P36551	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC1A2	P43004	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NPY2R	P49146	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ACTR3	P61158	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MXRA7	P84157	204 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CDK16	Q00536	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CAV1	Q03135	178 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	COTL1	Q14019	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	E2F2	Q14209	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	OR7E24	Q6IFN5	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	DPPA4	Q7L190	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KCNMB4	Q86W47	210 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NKAIN4	Q8IVV8	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	BIRC7	Q96CA5	298 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C14orf79	Q96F83	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	SSX3	Q99909	188 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ASB8	Q9H765	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	IL17C	Q9P0M4	197 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	RCE1	Q9Y256	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	GLYATL1P3	A0A0U1RQE8	302 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ARID1B-226	ENST00000637548	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms