RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PRDM9Q9NQV7 894 aa23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CAPNS1-215ENST00000628018 SGK494L7N484 410 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CLIC1O00299 241 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FOXS1O43638 330 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1G2O95670 118 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FOLR1P15328 257 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GAB1Q13480 694 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GRM7Q14831 915 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FXNQ16595 210 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPAL1Q6NVV3 410 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR23CQ6ZRP0 262 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR155Q7Z3F1 870 aa23.51■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CA13Q8N1Q1 262 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 IRAK4Q9NWZ3 460 aa23.51■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM150CB9EJG8 249 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 C1QCP02747 245 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 HTR1EP28566 365 aa23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC14A1Q13336 389 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10A6Q8NH74 314 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RHBDD1Q8TEB9 315 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFP90Q8TF47 636 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 JADE3Q92613 823 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 TPT1P8Q9HAU6 139 aa23.5■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 MYO1GB0I1T2 1018 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR2B3O76000 313 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GZMMP51124 257 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SKP1P63208 163 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CEBPEQ15744 281 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CALHM3Q86XJ0 350 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TRIML2Q8N7C3 387 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 OR1L3Q8NH93 324 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAP29Q9UHQ4 241 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 USP22Q9UPT9 525 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SPACA6W5XKT8 324 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 RDH16O75452 317 aa23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPX2P18283 190 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PPIBP23284 216 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR4D2P58180 307 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52E8Q6IFG1 317 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 C10orf111Q8N326 155 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DTWD1Q8N5C7 304 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PRSS33Q8NF86 280 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA8Q8TAA3 256 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 AMDHD1Q96NU7 426 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 MUC13Q9H3R2 512 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GLIPR2Q9H4G4 154 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PIF1Q9H611 641 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf36Q9H7Y0 433 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NEUROD4Q9HD90 331 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 EGFL7Q9UHF1 273 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa23.49■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GP1BAP07359 652 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 NTSP30990 170 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 GCGRP47871 477 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ERFP50548 548 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB38P57729 211 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ABHD18Q0P651 414 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 DHFR2Q86XF0 187 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 SHISA5Q8N114 240 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4FQ8N1N0 589 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 HIPK4Q8NE63 616 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF681Q96N22 645 aa23.48■■□□□ 1.35
CAPNS1-215ENST00000628018 BBS4Q96RK4 519 aa23.48■■□□□ 1.35
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