RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF597Q96LX8 424 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC6A7Q99884 636 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 AGPAT1Q99943 283 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 DOHHQ9BU89 302 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 BPESC1Q9GZL8 116 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CFAP45Q9UL16 551 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.26□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 DPRXA6NFQ7 191 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 C4orf51C9J302 202 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PLOD2O00469 737 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 HCRTR2O43614 444 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PDE5AO76074 875 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SMC2O95347 1197 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 EPOP01588 193 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ESR1P03372 595 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CPN1P15169 458 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 EPHA1P21709 976 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GMPRP36959 345 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF4P78317 190 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 IRF9Q00978 393 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 BSPH1Q075Z2 132 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 TERF2Q15554 542 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GPR33Q49SQ1 333 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 HSDL2Q6YN16 418 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM13CQ8NE31 585 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 FIG4Q92562 907 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 FOXN4Q96NZ1 517 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 DUX5Q96PT3 197 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SPATA7Q9P0W8 599 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.25□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 KIF5CO60282 957 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 TSPAN15O95858 294 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CD8BP10966 210 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PPP3CBP16298 524 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 TPSB2P20231 275 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PNLIPRP1P54315 467 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 WASHC5Q12768 1159 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 TPSAB1Q15661 275 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SMPDL3AQ92484 453 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 NXNL1Q96CM4 212 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 OLFM3Q96PB7 478 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF670Q9BS34 389 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PIMREGQ9BSJ6 248 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SLITRK2Q9H156 845 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PROCRQ9UNN8 238 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 USP22Q9UPT9 525 aa7.24□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GNB5O14775 395 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 AVPP01185 164 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CSF3P09919 207 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 OR56A5P0C7T3 313 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GCH1P30793 250 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PPP1R2P41236 205 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 LHX2P50458 406 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CDH11P55287 796 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CDH15P55291 814 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CLDN18P56856 261 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 RELAQ04206 551 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 BMPR2Q13873 1038 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 DOC2AQ14183 400 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 GUSBP1Q15486 140 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CARTPTQ16568 116 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PIGGQ5H8A4 983 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ATL3Q6DD88 541 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 PACS1Q6VY07 963 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ASPGQ86U10 573 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC13A3Q8WWT9 602 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 S100PBPQ96BU1 408 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF112Q9ULX5 631 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC22A7Q9Y694 548 aa7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 C5orf60A6NFR6 353 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 E7EQL1 145 aa7.22□□□□□ -1.25
SPTAN1-212ENST00000627441 H7C0S8 307 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms