RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 MYRIPQ8NFW9 859 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5L2Q8NGL0 311 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF721Q8TF20 911 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXC2Q99958 501 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 MCMBPQ9BTE3 642 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 LYRM4Q9HD34 91 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPRR3Q9UBC9 169 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 CLGNO14967 610 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 CTAG2O75638 210 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 PIGAP37287 484 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 HSPA7P48741 367 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC10A1Q14973 349 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZZZ3Q8IYH5 903 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1191Q96A73 305 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 WDR34Q96EX3 536 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 DERL2Q9GZP9 239 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 LDAHQ9H6V9 325 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 POPDC3Q9HBV1 291 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 TGM3Q08188 693 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ASPHQ12797 758 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa23.67■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TCAIMQ8N3R3 496 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX31Q8N9S9 440 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO36Q8NEA4 188 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 NINJ1Q92982 152 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 VPS39Q96JC1 886 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 RUNDC3BQ96NL0 473 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 RHOJQ9H4E5 214 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CAB39LQ9H9S4 337 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D2AQ9NP31 389 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF358Q9NW07 568 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ALKBH4Q9NXW9 302 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa23.66■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM221AA4D161 298 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TP73O15350 636 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 HCN1O60741 890 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 RFPL3SP0C7P2 107 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4D1Q15615 310 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 PDK4Q16654 411 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 LYPD8Q6UX82 237 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 GPSM1Q86YR5 675 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4N5Q8IXE1 308 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 MS4A8Q9BY19 250 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-211ENST00000590874 ROGDIQ9GZN7 287 aa23.65■■□□□ 1.38
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CAPNS1-211ENST00000590874 MSH2P43246 934 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF20Q5VT98 475 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa23.64■■□□□ 1.37
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CAPNS1-211ENST00000590874 NUBPLQ8TB37 319 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TBCDQ9BTW9 1192 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC13O75165 2243 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HRKO00198 91 aa23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SH3BGRLO75368 114 aa23.63■■□□□ 1.37
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