RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, human

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTIF-208	ENST00000590422	PMPCA	Q10713	525 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	PDK4	Q16654	411 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	GPSM1	Q86YR5	675 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	GPALPP1	Q8IXQ4	340 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	PDPR	Q8NCN5	879 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	EXT2	Q93063	718 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
CTIF-208	ENST00000590422	FREM3	P0C091	2139 aa		11.21	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	NIN	Q8N4C6	2090 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	C17orf105	B2RV13	164 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ACOT7	O00154	380 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CLGN	O14967	610 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	STK16	O75716	305 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CCL3	P10147	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MAGEA5	P43359	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KCNC1	P48547	511 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DNASE1L1	P49184	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SLC12A2	P55011	1212 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RNF4	P78317	190 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FOXO1	Q12778	655 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	STX4	Q12846	297 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GXYLT1	Q4G148	440 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RTL6	Q6ICC9	239 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RTL4	Q6ZR62	310 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	IFT20	Q8IY31	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MORN4	Q8NDC4	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	NRGN	Q92686	78 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DAZL	Q92904	295 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KCNC2	Q96PR1	638 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SMC6	Q96SB8	1091 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GPR22	Q99680	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MS4A8	Q9BY19	250 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	HRK	O00198	91 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FGF17	O60258	216 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SCEL	O95171	688 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	IGHG3	P01860	377 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ACVR2A	P27037	513 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	MSH2	P43246	934 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	PLTP	P55058	493 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CAV1	Q03135	178 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DLG1	Q12959	904 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CHIT1	Q13231	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	E2F2	Q14209	437 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GK5	Q6ZS86	529 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	CYS1	Q717R9	158 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	TRIL	Q7L0X0	811 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	OR4N5	Q8IXE1	308 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	RNF175	Q8N4F7	328 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	KIAA1191	Q96A73	305 aa		11.19	□□□□□ -0.62
CTIF-208	ENST00000590422	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		11.19	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms