RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF813Q6ZN06 617 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZPA2 131 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TPRG1Q6ZUI0 275 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM57BQ71RH2 274 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF534Q76KX8 674 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 AMIGO2Q86SJ2 522 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC6Q86X45 466 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GPSM1Q86YR5 675 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BANPQ8N9N5 519 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC63Q8NA47 563 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TEX45Q8NA69 505 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CCNYQ8ND76 341 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ARRDC2Q8TBH0 407 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 URGCPQ8TCY9 931 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ST7LQ8TDW4 575 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZFAND2BQ8WV99 257 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HEXDCQ8WVB3 486 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC9A6Q92581 669 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GLT1D1Q96MS3 346 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MUS81Q96NY9 551 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 VAT1Q99536 393 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMP4Q99727 224 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM79Q9BSE2 394 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TASP1Q9H6P5 420 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MMP25Q9NPA2 562 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGVQ9NUD9 493 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM51Q9NW97 253 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DDIT4Q9NX09 232 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MIOSQ9NXC5 875 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SMPD4Q9NXE4 827 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 IL19Q9UHD0 177 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 USH1CQ9Y6N9 552 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.99□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DOCK4Q8N1I0 1966 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM159BA6NKW6 160 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HHLA1C9JL84 531 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 I3L4J1 428 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GOLGA8RI6L899 631 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 AP3B1O00203 1094 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMD3O43242 534 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SELENOFO60613 162 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF217O75362 1048 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ATP5HO75947 161 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 AP2A1O95782 977 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HRH2P25021 359 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ITGB8P26012 769 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PSMB4P28070 264 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXN2P32314 431 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 AVPR1AP37288 418 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 WNT5AP41221 380 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BRCC3P46736 316 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP3CCP48454 512 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LUMP51884 338 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LBX1P52954 281 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH12P55289 794 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SP3Q02447 781 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PLP2Q04941 152 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF33AQ06730 810 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FOXE3Q13461 319 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PRPSAP1Q14558 356 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MELKQ14680 651 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC1A5Q15758 541 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PARP6Q2NL67 630 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SYPL2Q5VXT5 272 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 STEAP4Q687X5 459 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PM20D1Q6GTS8 502 aa3.98□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CGB2Q6NT52 195 aa3.98□□□□□ -1.77
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