RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567234.1

LINC00543-201, long intergenic non-protein coding RNA 543, humanhuman

BASIC

Gene LINC00543, Length 1,845 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00543-201ENST00000567234 KRT75O95678 551 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF682O95780 498 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SEMG1P04279 462 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CMPK1P30085 196 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SERPINB10P48595 397 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZIC1Q15915 447 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 UTS2RQ9UKP6 389 aa22.13■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ISPDA4D126 451 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 H0Y8X5 98 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SEMA4FO95754 770 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NEDD8Q15843 81 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 XAF1Q6GPH4 301 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NAGSQ8N159 534 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FANCEQ9HB96 536 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SLC6A20Q9NP91 592 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.12■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 LRIT2A6NDA9 550 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 RTCAO00442 366 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TNFRSF21O75509 655 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ITIH1P19827 911 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TGM1P22735 817 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TPRG1LQ5T0D9 272 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TTC23Q5W5X9 447 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PRR23CQ6ZRP0 262 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 AMIGO1Q86WK6 493 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FBXL20Q96IG2 436 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SP140LQ9H930 580 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ENPP5Q9UJA9 477 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SNX7Q9UNH6 387 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 VCANP13611 3396 aa22.11■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SNAP29O95721 258 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 THRBP10828 461 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 UQCRC2P22695 453 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CCR5P51681 352 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SRP54P61011 504 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZP2Q05996 745 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CHAC2Q8WUX2 184 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 LCN9Q8WX39 176 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 JRKO75564 520 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NUDT7P0C024 238 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 DCTP40126 519 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 BCL6P41182 706 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CRATP43155 626 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 PPP2R2BQ00005 443 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 LRRC32Q14392 662 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 GCNT6Q5T4J0 391 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SLX4IPQ5VYV7 408 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF425Q6IV72 752 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 THAP5Q7Z6K1 395 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CADM3Q8N126 398 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 HMGB4Q8WW32 186 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 FKBP10Q96AY3 582 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 SLC22A18Q96BI1 424 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 DPH7Q9BTV6 452 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 KLF15Q9UIH9 416 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 CA14Q9ULX7 337 aa22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LINC00543-201ENST00000567234 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms